More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0651 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
293 aa  580  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  99.32 
 
 
293 aa  578  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  93.86 
 
 
293 aa  558  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  80.89 
 
 
293 aa  475  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  79.86 
 
 
293 aa  471  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  63.23 
 
 
278 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  63.82 
 
 
274 aa  362  3e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.14 
 
 
276 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.14 
 
 
276 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.14 
 
 
276 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.14 
 
 
276 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3119  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  63.23 
 
 
278 aa  353  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.11 
 
 
278 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.36 
 
 
277 aa  341  7e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.76 
 
 
277 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  58.16 
 
 
274 aa  339  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.11 
 
 
274 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.27 
 
 
275 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.66 
 
 
281 aa  338  5e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.76 
 
 
276 aa  338  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.32 
 
 
303 aa  338  5e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.7 
 
 
277 aa  338  7e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.76 
 
 
274 aa  338  7e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.08 
 
 
276 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1512  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.76 
 
 
276 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13116  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.73 
 
 
276 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3057  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.42 
 
 
276 aa  328  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.491781  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2575  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.42 
 
 
276 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2168  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.42 
 
 
276 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3120  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.42 
 
 
276 aa  328  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2038  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.42 
 
 
276 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0742  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.42 
 
 
276 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3092  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.42 
 
 
276 aa  328  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  56.1 
 
 
273 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.73 
 
 
274 aa  325  7e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.39 
 
 
274 aa  324  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.19 
 
 
276 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.63 
 
 
276 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.51 
 
 
270 aa  316  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.33 
 
 
274 aa  315  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.61 
 
 
276 aa  315  8e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.71 
 
 
273 aa  311  6.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  53.92 
 
 
276 aa  308  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1046  undecaprenyl-diphosphatase  53.77 
 
 
285 aa  305  7e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.500366  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.08 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.24 
 
 
277 aa  301  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.08 
 
 
277 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.74 
 
 
276 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  53.79 
 
 
276 aa  299  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.4 
 
 
276 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.74 
 
 
276 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.4 
 
 
277 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.56 
 
 
277 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.4 
 
 
277 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  53.55 
 
 
269 aa  292  5e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  52.73 
 
 
266 aa  276  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.24 
 
 
267 aa  264  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0481  undecaprenol kinase  46.34 
 
 
267 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  46.91 
 
 
268 aa  236  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.24 
 
 
280 aa  229  5e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.97 
 
 
283 aa  227  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.46 
 
 
268 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.22 
 
 
280 aa  225  8e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.05 
 
 
268 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 
268 aa  215  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  41.13 
 
 
283 aa  215  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  40.77 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5424  undecaprenol kinase  41.52 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2344  undecaprenol kinase  41.79 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373318  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.6 
 
 
268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.73 
 
 
268 aa  212  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0981  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.73 
 
 
268 aa  212  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.29 
 
 
272 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.07 
 
 
268 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0491  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.3 
 
 
267 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2811  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.73 
 
 
268 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1150  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.73 
 
 
268 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0215  undecaprenol kinase  40.07 
 
 
267 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086247  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.45 
 
 
266 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.09 
 
 
268 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.79 
 
 
268 aa  206  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.88 
 
 
268 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1807  putative undecaprenol kinase  41.22 
 
 
305 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  39.35 
 
 
267 aa  205  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4278  putative undecaprenol kinase  41.82 
 
 
306 aa  205  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000318908  normal  0.0359854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3568  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.64 
 
 
272 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0180564  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.65 
 
 
268 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0848  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.16 
 
 
278 aa  204  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3409  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.29 
 
 
272 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3561  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.01 
 
 
273 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0840276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3391  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.01 
 
 
273 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000584329  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3465  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.01 
 
 
273 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.01 
 
 
273 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.184869 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3395  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.01 
 
 
273 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1051  undecaprenol kinase, putative  43.84 
 
 
274 aa  203  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.566548  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.06 
 
 
273 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3591  putative undecaprenol kinase  41.82 
 
 
286 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0254  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.34 
 
 
265 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.28 
 
 
268 aa  202  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5002  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.34 
 
 
265 aa  201  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>