73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0585 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  100 
 
 
148 aa  300  4e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  71.14 
 
 
148 aa  218  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  60.53 
 
 
149 aa  182  2e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  43.07 
 
 
145 aa  114  4e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  41.5 
 
 
147 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  38.62 
 
 
152 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  40.46 
 
 
147 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  38.35 
 
 
147 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  41.35 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  41.35 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  41.35 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  40.6 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  35.9 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  41.3 
 
 
153 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  38.69 
 
 
153 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  40.58 
 
 
153 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  40.58 
 
 
153 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  32.32 
 
 
179 aa  71.2  4e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2017  TadE family protein  32.24 
 
 
151 aa  58.5  3e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  32.18 
 
 
135 aa  53.1  1e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  50 
 
 
135 aa  52.4  2e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  29.31 
 
 
137 aa  52.4  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  28.48 
 
 
163 aa  52  3e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  30.53 
 
 
165 aa  51.6  3e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  33.06 
 
 
154 aa  50.8  7e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  29.29 
 
 
134 aa  50.4  9e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  30.41 
 
 
165 aa  48.5  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  30.41 
 
 
161 aa  48.5  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  33.33 
 
 
163 aa  47.8  5e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  35.37 
 
 
126 aa  47  9e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  37.25 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.25282e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  35.06 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  44 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  37.25 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  44.62 
 
 
165 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  40 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  39.13 
 
 
180 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  38 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  36.54 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  5.14648e-08  hitchhiker  1.17146e-05 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  38 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  38 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  38 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  38 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  38 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  36.54 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.88684e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  38 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  36.54 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  1.50805e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  26.47 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  34.62 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  7.90558e-06  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  29.67 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  40.91 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  39.13 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  36.96 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  30 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  43.75 
 
 
165 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  31.58 
 
 
185 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  41.3 
 
 
143 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  46.94 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  26.61 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  35.29 
 
 
142 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  24.31 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  37.25 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  35.29 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  44.44 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  38.3 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  23.62 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  40.82 
 
 
156 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  46 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4700  TadE family protein  31.67 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  34.78 
 
 
177 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  34.78 
 
 
177 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  29.2 
 
 
722 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5124  TadE family protein  37.5 
 
 
141 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0349202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>