More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0565 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 389 aa  783    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  79.59 
 
 		 388 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  79.59 
 
 		 388 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  79.59 
 
 		 388 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  79.59 
 
 		 388 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 		 384 aa  276  3e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.38 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.64 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 		 397 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.95 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 		 385 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 		 385 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.21 
 
 		 385 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.08 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.15 
 
 		 382 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.3 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 		 382 aa  239  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  36.88 
 
 		 383 aa  239  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.97 
 
 		 382 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.08 
 
 		 402 aa  239  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  39.64 
 
 		 385 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  41.6 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.78 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.73 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  36.62 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  35.26 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 389 aa  236  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 389 aa  236  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.57 
 
 		 382 aa  235  9e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 		 383 aa  235  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 		 383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 		 383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.31 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.75 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  41.19 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.75 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.26 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.32 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.18 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 		 392 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.1 
 
 		 383 aa  229  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 395 aa  229  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  35.71 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.64 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.81 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  36.62 
 
 		 382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.71 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.31 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.2 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  39.69 
 
 		 392 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.82 
 
 		 382 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 		 382 aa  224  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 		 384 aa  223  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  36.62 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  35.28 
 
 		 387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.14 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  35.29 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.53 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 		 383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.42 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.73 
 
 		 384 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.1 
 
 		 382 aa  219  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 		 395 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.28 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  38 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3708  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.19 
 
 		 378 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0259556  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 		 387 aa  216  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>