More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0482 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  87.37 
 
 		 561 aa  991    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 569 aa  1143    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  58.51 
 
 		 605 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  97.36 
 
 		 567 aa  1075    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  58.38 
 
 		 573 aa  618  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  48.45 
 
 		 562 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  45.28 
 
 		 565 aa  445  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  47.26 
 
 		 588 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  50.41 
 
 		 590 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  50.31 
 
 		 588 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  51.43 
 
 		 564 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  46.9 
 
 		 564 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  47.07 
 
 		 564 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  50.31 
 
 		 588 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  46.71 
 
 		 562 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  50.41 
 
 		 593 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  46.28 
 
 		 569 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  51.13 
 
 		 589 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  50.92 
 
 		 589 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  50.92 
 
 		 589 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  50.92 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  50.92 
 
 		 560 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  50.92 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  50.92 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  50.92 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  41.3 
 
 		 479 aa  318  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  36.89 
 
 		 502 aa  300  5e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  38 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  34.86 
 
 		 473 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  37.8 
 
 		 533 aa  252  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  34.6 
 
 		 475 aa  249  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  37.58 
 
 		 518 aa  247  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  35.83 
 
 		 484 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  36.05 
 
 		 553 aa  239  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  42 
 
 		 548 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  36.22 
 
 		 541 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  33.99 
 
 		 521 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  34.18 
 
 		 521 aa  224  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  34.11 
 
 		 549 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  32.51 
 
 		 486 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  33.94 
 
 		 521 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  44.8 
 
 		 514 aa  213  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  33.68 
 
 		 477 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  32.37 
 
 		 489 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  34.58 
 
 		 500 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  32.29 
 
 		 489 aa  208  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  32.29 
 
 		 489 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  31.87 
 
 		 485 aa  207  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  31.15 
 
 		 487 aa  207  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  33.47 
 
 		 477 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  31.87 
 
 		 489 aa  206  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  32.76 
 
 		 554 aa  205  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  33.56 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  31.24 
 
 		 489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  33.4 
 
 		 477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  32.36 
 
 		 486 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  31.24 
 
 		 489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  31.24 
 
 		 489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  31.24 
 
 		 489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  30.61 
 
 		 485 aa  200  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  30.59 
 
 		 483 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  32.71 
 
 		 477 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  31.43 
 
 		 480 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  31.43 
 
 		 478 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  31.06 
 
 		 486 aa  193  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  32.21 
 
 		 478 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  30.93 
 
 		 489 aa  193  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  32.21 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  32.21 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  36.36 
 
 		 486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  30.99 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  31.73 
 
 		 487 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  31.17 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  31.14 
 
 		 488 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  32.01 
 
 		 477 aa  187  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  30.95 
 
 		 483 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  29.57 
 
 		 484 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  28.75 
 
 		 484 aa  183  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  34.6 
 
 		 490 aa  181  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  30.17 
 
 		 490 aa  180  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  28.99 
 
 		 503 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  29.87 
 
 		 494 aa  177  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  30.44 
 
 		 524 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  30.75 
 
 		 561 aa  176  8e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  30.59 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  30.25 
 
 		 553 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  29.66 
 
 		 494 aa  174  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  31.38 
 
 		 487 aa  173  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  31.15 
 
 		 487 aa  171  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  31.15 
 
 		 487 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  31.15 
 
 		 487 aa  171  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0392  peptidase M48, Ste24p  46.47 
 
 		 525 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  31.15 
 
 		 487 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  31.15 
 
 		 487 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  31.15 
 
 		 487 aa  171  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  30.21 
 
 		 487 aa  170  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  31.07 
 
 		 487 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  31.07 
 
 		 487 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  31.07 
 
 		 487 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  30.93 
 
 		 487 aa  170  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>