14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0440 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0440  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  650    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000177301  hitchhiker  0.000000000000366225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3210  hypothetical protein  47.44 
 
 		 321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0244916 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1682  hypothetical protein  50.54 
 
 		 119 aa  97.4  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1615  hypothetical protein  49.46 
 
 		 103 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1683  hypothetical protein  60.56 
 
 		 83 aa  90.9  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.396672  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1616  hypothetical protein  59.15 
 
 		 83 aa  90.1  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1798  hypothetical protein  30.18 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2312  hypothetical protein  38.78 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000231336  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3051  hypothetical protein  30.41 
 
 		 267 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2222  hypothetical protein  23.45 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00344567  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3694  hypothetical protein  31.69 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000233767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1627  hypothetical protein  29.29 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4789  hypothetical protein  27.52 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.292295 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1697  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000463724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>