More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0398 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0398  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0413  phospholipid/glycerol acyltransferase  95.6 
 
 
250 aa  497  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0522  putative acyltransferase transmembrane protein  87.2 
 
 
250 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00553836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0505  phospholipid/glycerol acyltransferase  71.2 
 
 
249 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0444  phospholipid/glycerol acyltransferase  70.04 
 
 
253 aa  343  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0582  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  65.86 
 
 
259 aa  340  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0595  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.92 
 
 
254 aa  339  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0699  acyltransferase family protein  65.06 
 
 
259 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0714  acyltransferase family protein  65.06 
 
 
259 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0216  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  65.06 
 
 
259 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0878  phospholipid and glycerol acyltransferase  65.06 
 
 
259 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2428  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  65.06 
 
 
259 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2730  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  65.06 
 
 
259 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2348  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  65.06 
 
 
259 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4015  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  64.78 
 
 
252 aa  332  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066125  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6031  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  66.13 
 
 
254 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0403  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.26 
 
 
252 aa  330  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.355524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0684  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.78 
 
 
252 aa  329  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357899  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2731  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.52 
 
 
254 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2621  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.52 
 
 
254 aa  325  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741388  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.52 
 
 
254 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389917  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2704  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.52 
 
 
254 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2756  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.11 
 
 
254 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1866  phospholipid/glycerol acyltransferase  55.47 
 
 
244 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.42 
 
 
244 aa  288  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.983241  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0546  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.23 
 
 
249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0530  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.82 
 
 
249 aa  250  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0626178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0447  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.41 
 
 
255 aa  247  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0213  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.4 
 
 
254 aa  247  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0954935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3378  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.78 
 
 
254 aa  238  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.611462  normal  0.54749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4200  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.56 
 
 
256 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2345  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.37 
 
 
240 aa  234  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3693  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.34 
 
 
244 aa  231  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869858  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0957  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.92 
 
 
252 aa  230  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4741  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.77 
 
 
258 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1291  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.16 
 
 
246 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0873  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.4 
 
 
258 aa  220  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000151489  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4174  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.77 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal  0.278578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2165  phospholipid/glycerol acyltransferase  50 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0642  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.44 
 
 
236 aa  206  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0548  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.68 
 
 
283 aa  192  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3537  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.4 
 
 
250 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0406833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0005  acyltransferase  40.32 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00060  putative acyltransferase  40.73 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0375  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.24 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1022  putative acyltransferase  36.32 
 
 
236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508637  normal  0.11203 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2573  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.33 
 
 
251 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0009  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.13 
 
 
253 aa  178  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3254  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.52 
 
 
248 aa  178  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1223  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.17 
 
 
248 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6169  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5696  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.47 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.226605 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7109  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.76 
 
 
240 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.135036 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2052  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.04 
 
 
257 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.850396  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2052  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  40.97 
 
 
249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00080  LPA acyltransferase protein  37.45 
 
 
242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.729238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0011  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.33 
 
 
255 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.48 
 
 
261 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000544756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0058  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.89 
 
 
261 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000912039  unclonable  0.000000385865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.89 
 
 
261 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000185774  normal  0.109161 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0009  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.01 
 
 
256 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00250914  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0187  hdtS protein  34.01 
 
 
256 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0077  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.89 
 
 
256 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000191625  decreased coverage  0.0000000000082307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0007  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.66 
 
 
274 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000602556  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0357  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.54 
 
 
249 aa  152  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4864  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.22 
 
 
262 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.238308 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0455  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.15 
 
 
251 aa  152  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0837  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.76 
 
 
269 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4243  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.61 
 
 
250 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0459048  hitchhiker  0.000000000931416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0011  Protoheme IX farnesyltransferase  37.19 
 
 
240 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2324  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.17 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000640297  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0579  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.89 
 
 
259 aa  143  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0987  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.61 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0946  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.73 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.588556  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0670  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.08 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776916  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2212  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.17 
 
 
242 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2584  acyltransferase family protein  36.17 
 
 
242 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1920  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.54 
 
 
300 aa  138  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1994  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  31.54 
 
 
260 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1179  putative 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase (plsC)  34.8 
 
 
255 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3257  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.33 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0043  acyltransferase family protein  31.88 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0953  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.14 
 
 
244 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3541  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.47 
 
 
250 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5215  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.12 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1149  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  32.5 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0562446  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3220  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.39 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.418281  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0019  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.94 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.917675  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1592  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.37 
 
 
257 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.03 
 
 
249 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0473137  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2546  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.91 
 
 
259 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3010  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3088  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.64 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3069  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.92 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.0056603  hitchhiker  0.00898563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2439  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.92 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3562  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.02 
 
 
264 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3747  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.12 
 
 
244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0236961  normal  0.0298826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4060  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.07 
 
 
231 aa  111  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1538  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.68 
 
 
263 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.011975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3868  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.22 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.39528  normal  0.122725 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0042  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.51 
 
 
240 aa  109  5e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>