268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0389 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  100 
 
 		 242 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  97.11 
 
 		 242 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  85.12 
 
 		 242 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  71.49 
 
 		 257 aa  289  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  69.78 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  51.77 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  50.66 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  50.64 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  56.77 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  49.12 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  42.79 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  44.54 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  43.16 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  43.16 
 
 		 253 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  43.17 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  45.21 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  44.8 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  40.73 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  37.5 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  42.53 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  42.53 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  41.99 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  38.46 
 
 		 244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  43.93 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  38.4 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  42.25 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  42.58 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  39.74 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  43.14 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  43.14 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  38.16 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  38.16 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  37.56 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  35.78 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  36.29 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  40.27 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  30.77 
 
 		 236 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  33.91 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  30.89 
 
 		 286 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  31.78 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  31.78 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  31.78 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  31 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  32.88 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  31 
 
 		 293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  41.67 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  30.18 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  31.25 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  30.67 
 
 		 237 aa  112  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  32 
 
 		 233 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  30.42 
 
 		 255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  31.56 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  31.56 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  31.56 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  30.04 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  32.17 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  29.39 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  31.74 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  34.22 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  39.18 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  34.03 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  36.14 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  36.36 
 
 		 246 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  33.33 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  30.09 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  30.56 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  34.6 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  31.56 
 
 		 234 aa  98.6  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  36.65 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  32.09 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  34.67 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  30 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  29.12 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  30.22 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  29.61 
 
 		 251 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  34.92 
 
 		 248 aa  95.1  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  31.64 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  30 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  29.65 
 
 		 276 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  30.87 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  30 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  30 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  30 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  30 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  30 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  29.57 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  29.13 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  32.07 
 
 		 233 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3065  AzlC family protein  33.92 
 
 		 237 aa  92  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  28.57 
 
 		 242 aa  91.7  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  29.17 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  26.39 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  33.04 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  31.36 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  31.36 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0724  AzlC family protein  31.07 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  28.63 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  31.36 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  31.36 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  31.77 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>