192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0344 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  98.39 
 
 		 248 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  92.28 
 
 		 248 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  79.12 
 
 		 262 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  74.69 
 
 		 251 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3642  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748827  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.77 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.15 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.67 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  45.49 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  39.92 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  43.27 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  40.25 
 
 		 257 aa  198  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0445  endonuclease / exonuclease / phosphatase family protein  45.15 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.625659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2631  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.85 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363839 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.39 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.26 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.26 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.67 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2645  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.03 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150024  normal  0.299573 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.78 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.31 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.72 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  44.86 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.26 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.32 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.72 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  45.27 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.67 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0014  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.09 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  44.62 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  39.26 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.13 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  38.84 
 
 		 255 aa  181  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.28 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.68 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3616  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.97 
 
 		 287 aa  180  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.62 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.62 
 
 		 279 aa  179  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.92 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2284  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.12 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0656369  hitchhiker  0.000754964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3655  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.8 
 
 		 264 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227458 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.02 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  42.44 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.13 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.74 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4056  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.98 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1391  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.22 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1787  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.98 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.717183  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2538  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.57 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.98 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.59 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.98478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1281  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.3 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.08 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0938  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  39.84 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2852  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.84 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0813  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  39.84 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0192282  normal  0.85473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  39.43 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00774  hypothetical protein  39.43 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.43 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  39.43 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  39.43 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0908  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  39.84 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0848  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  39.84 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0961  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  39.84 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0876  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  39.84 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  39.84 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00426171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2562  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  39.43 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.34 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0102  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.55 
 
 		 265 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4337  putative metal-dependent hydrolase  35.34 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.01 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3096  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.61 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.61 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.22 
 
 		 271 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3052  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.22 
 
 		 271 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3071  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.22 
 
 		 271 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3049  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.61 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.687036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0429  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.97 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2960  hypothetical protein  35.97 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2128  hypothetical protein  35.97 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0235  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.97 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0247  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.97 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3386  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.97 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0213  hypothetical protein  38.7 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.81 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3294  hypothetical protein  37.83 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.65 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.2 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.28 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.69 
 
 		 282 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  32.4 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.56 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.97 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.42 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.52 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.52 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.93 
 
 		 244 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>