More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0297 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 		 263 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  98.48 
 
 		 263 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  81.37 
 
 		 263 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  77.57 
 
 		 263 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  77.19 
 
 		 263 aa  430  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  79.09 
 
 		 263 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  73 
 
 		 263 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  76.25 
 
 		 262 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  67.73 
 
 		 262 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  65.48 
 
 		 263 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  64.64 
 
 		 258 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  65.1 
 
 		 263 aa  358  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  63.36 
 
 		 262 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  65.87 
 
 		 263 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  65.87 
 
 		 263 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  65.87 
 
 		 263 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  65.48 
 
 		 263 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  65.48 
 
 		 263 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  65.48 
 
 		 263 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  70.54 
 
 		 257 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  65.48 
 
 		 263 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  62.79 
 
 		 262 aa  349  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  62.79 
 
 		 262 aa  349  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  62.95 
 
 		 259 aa  347  9e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  64.68 
 
 		 263 aa  346  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  64.44 
 
 		 262 aa  341  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  63.1 
 
 		 257 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  64.85 
 
 		 262 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  63.6 
 
 		 262 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  65.48 
 
 		 258 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  59.38 
 
 		 258 aa  321  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  60 
 
 		 258 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  61.98 
 
 		 249 aa  316  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  60.74 
 
 		 249 aa  309  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  58.75 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  58.09 
 
 		 259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  53.99 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  55 
 
 		 259 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  56.49 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.46 
 
 		 256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.65 
 
 		 261 aa  285  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.51 
 
 		 239 aa  284  9e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  55.79 
 
 		 260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  54.29 
 
 		 255 aa  281  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  49.81 
 
 		 263 aa  275  7e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  53.04 
 
 		 241 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  55.14 
 
 		 215 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  54.42 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  54.42 
 
 		 255 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  53.71 
 
 		 241 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  39.39 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  39.44 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  35.86 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  37.66 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  36.47 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  37.66 
 
 		 234 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  37.5 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  34.65 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.25 
 
 		 240 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.41 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.41 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.62 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  35.5 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.82 
 
 		 251 aa  138  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  36.55 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.92 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  34.12 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.59 
 
 		 233 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  33.06 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  32.65 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  30.57 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  32.66 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.76 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.51 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  39.88 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  39.88 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  40.61 
 
 		 318 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.96 
 
 		 517 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  34.02 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  33.14 
 
 		 206 aa  92  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.24 
 
 		 501 aa  89.7  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.4 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.82 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.32 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.86 
 
 		 495 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.19 
 
 		 230 aa  85.5  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.58 
 
 		 311 aa  85.5  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.68 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.56 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  32.18 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  31.79 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.67 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3981  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.38 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.678928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  30.64 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.68 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.83 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.68 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2134  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.82 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.43 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.348188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>