More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0282 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0280  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0839  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4189  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0203984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1472  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  hitchhiker  0.0000000061628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0282  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.823794 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0489  putative transposase IS4  89.14 
 
 		 268 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4955  transposase IS4 family protein  84.7 
 
 		 281 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0091  transposase, IS4 family protein  81.18 
 
 		 270 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0399  transposase, IS4 family protein  81.18 
 
 		 270 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1399  transposase, IS4 family protein  81.18 
 
 		 270 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.878322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1799  transposase, IS4 family protein  81.18 
 
 		 270 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2423  transposase, IS4 family protein  81.18 
 
 		 270 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2530  transposase, IS4 family protein  81.18 
 
 		 270 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2707  transposase, IS4 family protein  81.18 
 
 		 270 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2939  transposase, IS4 family protein  81.18 
 
 		 270 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3263  transposase, IS4 family protein  81.18 
 
 		 270 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3765  transposase, IS4 family protein  81.18 
 
 		 270 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4617  transposase, IS4 family protein  81.18 
 
 		 270 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03511  transposase and inactivated derivatives  81.48 
 
 		 243 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03985  transposase (IS4 family)  83.1 
 
 		 213 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1298  transposase IS4 family protein  64.75 
 
 		 269 aa  360  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1042  transposase, IS4  59.32 
 
 		 265 aa  323  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.241795  normal  0.0215531 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1699  transposase, IS4  59.32 
 
 		 265 aa  323  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0430056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2208  transposase, IS4  59.32 
 
 		 265 aa  323  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2276  transposase, IS4  59.32 
 
 		 265 aa  323  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00100946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2925  transposase IS4 family protein  58.49 
 
 		 269 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6839  transposase IS4 family protein  64.25 
 
 		 274 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  39.67 
 
 		 308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  36.73 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  39.57 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  39.57 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  39.57 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  39.57 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  39.57 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  39.57 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  39.57 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  39.57 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  39.57 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  39.57 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  39.57 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  39.57 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  37.64 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  35.32 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  36.78 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0837  hypothetical protein  84.52 
 
 		 163 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815342 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  35.71 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  38.35 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  38.35 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  38.35 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  37.55 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  37.55 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  37.55 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  37.55 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  37.55 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  37.55 
 
 		 274 aa  159  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  37.55 
 
 		 274 aa  159  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  37.55 
 
 		 274 aa  159  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  38.55 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  38.55 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  38.17 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  37.97 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  37.15 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  37.4 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  37.4 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  37.4 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  37.4 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  37.4 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  37.4 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  37.4 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  37.4 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  35.02 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  36.76 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  35.86 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  35.86 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  37.89 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  36.51 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  32.08 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  32.08 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  32.08 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  32.08 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  32.08 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  32.08 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  32.08 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  32.08 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  32.08 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  32.08 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  32.08 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  32.08 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  32.08 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  32.08 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  36.4 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  36.4 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  36.4 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  37.97 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  37.97 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  35.23 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  35.23 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  35.23 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.501241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>