More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0272 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 202 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  97.52 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  93.3 
 
 		 231 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  84.57 
 
 		 190 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  84.57 
 
 		 205 aa  321  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0333  adenine phosphoribosyltransferase  73.4 
 
 		 188 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  77.65 
 
 		 184 aa  279  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0603  adenine phosphoribosyltransferase  71.28 
 
 		 188 aa  275  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0244339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  74.86 
 
 		 184 aa  272  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  74.86 
 
 		 184 aa  271  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  74.3 
 
 		 185 aa  268  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4115  adenine phosphoribosyltransferase  71.35 
 
 		 188 aa  268  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0588  adenine phosphoribosyltransferase  71.91 
 
 		 216 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  69.27 
 
 		 194 aa  263  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  71.04 
 
 		 196 aa  261  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0772  adenine phosphoribosyltransferase  71.35 
 
 		 187 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0604  adenine phosphoribosyltransferase  71.35 
 
 		 197 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  70.69 
 
 		 188 aa  258  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  69.54 
 
 		 188 aa  255  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0493  adenine phosphoribosyltransferase  69.1 
 
 		 188 aa  254  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  68.54 
 
 		 188 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2702  adenine phosphoribosyltransferase  67.98 
 
 		 188 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2844  adenine phosphoribosyltransferase  67.98 
 
 		 188 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  68.97 
 
 		 188 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  68.97 
 
 		 188 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  62.29 
 
 		 180 aa  234  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  60.82 
 
 		 181 aa  224  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1521  adenine phosphoribosyltransferase  64.57 
 
 		 206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.781785  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0069  adenine phosphoribosyltransferase  64.57 
 
 		 206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 		 181 aa  204  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 		 181 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 		 181 aa  205  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 		 181 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2232  adenine phosphoribosyltransferase  51.72 
 
 		 180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0145  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  55.75 
 
 		 179 aa  197  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  56.07 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  56.07 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 		 187 aa  194  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 		 187 aa  194  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 		 175 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3789  adenine phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 		 182 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 		 175 aa  190  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44500  adenine phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.772947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2616  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0092322  normal  0.996002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  50.56 
 
 		 181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  51.69 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  49.47 
 
 		 199 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 		 177 aa  187  9e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1810  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  46.82 
 
 		 181 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 		 180 aa  184  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 		 181 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 		 183 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  50.86 
 
 		 178 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  49.14 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  48.89 
 
 		 180 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 		 178 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  48 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  48 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  48 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  48 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  48 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  48 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  47.43 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 		 181 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  48 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  48 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  49.44 
 
 		 181 aa  181  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3426  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 		 182 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  46.82 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1990  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  46.82 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  47.73 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  46.82 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 173 aa  177  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 		 182 aa  177  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4266  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0935  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 175 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3831  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.660838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1602  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3584  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 		 185 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>