More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0198 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  217  4e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  217  4e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  3.68327e-06 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  97.32 
 
 
112 aa  214  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  93.75 
 
 
112 aa  207  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  92.86 
 
 
112 aa  207  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  88.39 
 
 
112 aa  195  2e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  193  8e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  84.82 
 
 
112 aa  193  8e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  193  8e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  193  8e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  193  8e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  193  8e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  193  8e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  193  8e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
136 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
136 aa  192  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1663  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 
112 aa  192  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.824699  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 
112 aa  189  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  187  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  187  6e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  187  6e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 
112 aa  186  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  186  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  186  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  186  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  186  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  186  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  185  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  185  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  185  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  184  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  183  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  79.46 
 
 
112 aa  182  1e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  182  1e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  182  2e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  181  2e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  181  2e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  181  2e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  181  4e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  79.46 
 
 
112 aa  181  4e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  77.68 
 
 
112 aa  181  4e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  77.68 
 
 
112 aa  181  4e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  181  4e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  180  5e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.93377e-06  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  180  5e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  180  8e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  179  8e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  179  8e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  179  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  76.79 
 
 
112 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  177  3e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  178  3e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  177  3e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  177  5e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  177  5e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  177  5e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  177  5e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  177  5e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  177  5e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  177  5e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  177  6e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  75 
 
 
112 aa  176  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  75 
 
 
112 aa  176  7e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  176  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  176  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  175  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
114 aa  176  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  175  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  175  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  175  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  175  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  174  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  174  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  80.37 
 
 
112 aa  174  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  174  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  174  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  174  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 
112 aa  174  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  174  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  174  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  173  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  75 
 
 
112 aa  173  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  173  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  173  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  173  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  172  1e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  80.37 
 
 
112 aa  172  1e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  172  1e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  172  1e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  172  2e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>