More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0101 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  50.28 
 
 		 763 aa  682    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  44.09 
 
 		 730 aa  635    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  50.28 
 
 		 780 aa  680    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  57.32 
 
 		 748 aa  783    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  57.75 
 
 		 748 aa  794    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  54.59 
 
 		 747 aa  783    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  47.38 
 
 		 760 aa  655    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  97.5 
 
 		 759 aa  1482    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  48.56 
 
 		 762 aa  663    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  49.41 
 
 		 747 aa  697    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  49.38 
 
 		 768 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  53.94 
 
 		 747 aa  791    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  57.89 
 
 		 748 aa  797    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  48.67 
 
 		 773 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  52.62 
 
 		 776 aa  716    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  54.59 
 
 		 747 aa  783    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  57.18 
 
 		 747 aa  799    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  58.33 
 
 		 772 aa  796    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  44.22 
 
 		 730 aa  638    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  56.28 
 
 		 749 aa  823    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  50.34 
 
 		 766 aa  716    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 759 aa  1549    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  54.46 
 
 		 747 aa  781    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  44.36 
 
 		 730 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  57.89 
 
 		 748 aa  797    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  54.2 
 
 		 747 aa  791    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  47.23 
 
 		 753 aa  661    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  44.43 
 
 		 731 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  44.09 
 
 		 730 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  44.3 
 
 		 731 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  44.3 
 
 		 731 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  45.22 
 
 		 730 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  46.81 
 
 		 741 aa  608  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  41.8 
 
 		 826 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  43.92 
 
 		 753 aa  605  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  44 
 
 		 741 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  43.41 
 
 		 769 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  43 
 
 		 740 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  42.44 
 
 		 794 aa  531  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  38.83 
 
 		 724 aa  504  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  37.52 
 
 		 751 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  39.23 
 
 		 733 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  39.01 
 
 		 765 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  38.01 
 
 		 733 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  37.37 
 
 		 731 aa  426  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  38.15 
 
 		 732 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  36.69 
 
 		 793 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  35.93 
 
 		 794 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  36.25 
 
 		 793 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  34.2 
 
 		 769 aa  395  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  35.51 
 
 		 760 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  37.09 
 
 		 764 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  36.67 
 
 		 733 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  35.51 
 
 		 760 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  35.37 
 
 		 760 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  35.51 
 
 		 760 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  35.51 
 
 		 760 aa  388  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  35.37 
 
 		 760 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  35.37 
 
 		 760 aa  388  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 		 733 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  35.37 
 
 		 760 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  33.96 
 
 		 754 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  36.7 
 
 		 733 aa  382  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  36.35 
 
 		 821 aa  382  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  35.63 
 
 		 805 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  31.68 
 
 		 743 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1513  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 		 859 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.691941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  35.87 
 
 		 753 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  34.04 
 
 		 751 aa  365  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 		 745 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 		 742 aa  363  6e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 		 742 aa  363  6e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  35.61 
 
 		 823 aa  361  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  33.93 
 
 		 769 aa  359  8e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1314  putative TonB-dependent receptor protein  34.51 
 
 		 843 aa  359  9e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711074 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1637  catecholate siderophore receptor Fiu  32.8 
 
 		 763 aa  357  5.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.824429  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 785 aa  352  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  32.15 
 
 		 779 aa  352  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 790 aa  343  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  32.63 
 
 		 734 aa  333  8e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 732 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  32.64 
 
 		 732 aa  325  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1524  TonB-dependent siderophore receptor  30.79 
 
 		 847 aa  318  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  32.84 
 
 		 736 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 		 734 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 		 777 aa  304  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 803 aa  303  8.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 		 727 aa  300  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 748 aa  290  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 815 aa  287  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 767 aa  281  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 768 aa  281  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  31.87 
 
 		 719 aa  281  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2275  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 779 aa  272  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00175316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  31.6 
 
 		 792 aa  270  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  29.07 
 
 		 720 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 		 737 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03559  putative outer membrane receptor for iron transport  28.79 
 
 		 761 aa  253  9.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 707 aa  253  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3085  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 767 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  0.216415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>