134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0050 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  273  8e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  97.73 
 
 		 132 aa  267  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  85.38 
 
 		 130 aa  236  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  80.15 
 
 		 133 aa  222  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  75.38 
 
 		 131 aa  216  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  75.38 
 
 		 131 aa  215  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  76.56 
 
 		 132 aa  211  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  72.87 
 
 		 130 aa  208  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  70 
 
 		 131 aa  202  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  68.99 
 
 		 132 aa  197  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  64.89 
 
 		 134 aa  187  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  64.89 
 
 		 134 aa  186  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  64.89 
 
 		 134 aa  186  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  64.12 
 
 		 134 aa  185  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  63.36 
 
 		 163 aa  184  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  63.36 
 
 		 139 aa  184  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  62.6 
 
 		 134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  62.6 
 
 		 134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  62.6 
 
 		 134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  62.6 
 
 		 134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  62.6 
 
 		 134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  62.6 
 
 		 134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  62.6 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  63.36 
 
 		 134 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  63.36 
 
 		 134 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  69.03 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  64.8 
 
 		 133 aa  176  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  47.9 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0115  dihydroneopterin aldolase  37.72 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  41.38 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  38.71 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2913  dihydroneopterin aldolase  32.33 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1464  dihydroneopterin aldolase  27.88 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2277  dihydroneopterin aldolase  31.03 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  28.81 
 
 		 300 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  28.81 
 
 		 300 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  28.81 
 
 		 311 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  34.65 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  34.82 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0506  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.250625  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3163  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  31.13 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  31.36 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0774  dihydroneopterin aldolase  35.71 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349687  normal  0.309936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3078  dihydroneopterin aldolase  27.68 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0975  dihydroneopterin aldolase  26.92 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0517  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30 
 
 		 291 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0814  dihydroneopterin aldolase  25.21 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2345  dihydroneopterin aldolase  26.79 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  31.36 
 
 		 306 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0495  dihydroneopterin aldolase  25.96 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0418913 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  25.66 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0543  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 		 272 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.968612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1159  dihydroneopterin aldolase  25.66 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000272925  normal  0.0363413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  28.21 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233829  normal  0.020478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  28.21 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0517  dihydroneopterin aldolase  27.36 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1046  dihydroneopterin aldolase  27.83 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0337595  normal  0.538227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4088  dihydroneopterin aldolase  25.96 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1249  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2328  dihydroneopterin aldolase  24.11 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00313661  normal  0.014777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  27.43 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4226  dihydroneopterin aldolase  25.96 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265361 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  30.69 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1078  dihydroneopterin aldolase  25.66 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2988  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3081  dihydroneopterin aldolase  27.35 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00105376  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2910  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  24.79 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00855  hypothetical protein  23.89 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001617  dihydroneopterin aldolase  23.89 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.156687  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1150  dihydroneopterin aldolase  28.21 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00780302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1194  dihydroneopterin aldolase  28.21 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.07568  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3163  dihydroneopterin aldolase  28.21 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.825966  normal  0.332579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1227  dihydroneopterin aldolase  28.21 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00906194  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5943  dihydroneopterin aldolase  28.35 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013743 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  27.35 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0971  dihydroneopterin aldolase  25.89 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.547103  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0052  putative dihydroneopterin aldolase FolB  24 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148451  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0116  dihydroneopterin aldolase  25.86 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126497  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  23.01 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02300  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  26.32 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.52127  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4345  dihydroneopterin aldolase  30.93 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1540  hypothetical protein  26.61 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100724  normal  0.790758 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0620  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  24.78 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2066  dihydroneopterin aldolase  25.86 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000254048  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0329  dihydroneopterin aldolase  26.55 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0663  dihydroneopterin aldolase  26.55 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0965  dihydroneopterin aldolase  27.73 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0312148  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2438  dihydroneopterin aldolase  25.89 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2785  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  25.47 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3146  dihydroneopterin aldolase  26.32 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2381  dihydroneopterin aldolase  25.44 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1710  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  27.5 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.763484  normal  0.0426058 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2063  dihydroneopterin aldolase  25.22 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.424168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0828  dihydroneopterin aldolase  22.32 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0250396  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0829  dihydroneopterin aldolase  23.89 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000184652  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  21.24 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46950  Dihydroneopterin aldolase  23.01 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0794  dihydroneopterin aldolase  23.21 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.19787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1002  dihydroneopterin aldolase  25.86 
 
 		 117 aa  43.5  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00980814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>