39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0044 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0044  band 7 protein  100 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.179688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0038  band 7 protein  99.34 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0145  putative transmembrane protein  89.74 
 
 		 302 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.943019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1663  hypothetical protein  32.32 
 
 		 341 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0534  bacteriophage/transposase fusion protein  32.93 
 
 		 399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1945  bacteriophage/transposase fusion protein  32.93 
 
 		 462 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1017  bacteriophage/transposase fusion protein  31.45 
 
 		 270 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0310816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  29.18 
 
 		 318 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5185  band 7 protein  27.87 
 
 		 277 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.133466 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0051  hypothetical protein  26.69 
 
 		 276 aa  92  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.10901e-82  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5610  band 7 protein  29.15 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.606547  normal  0.386273 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  26.06 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  25.69 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  22.13 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  25.3 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  22.63 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1182  membrane protease  26.47 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  22.92 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.23 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  22.15 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  24.34 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  21.91 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  25.51 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  25.51 
 
 		 268 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  27 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  20.69 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54958  prohibitin-like protein  25.97 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  22.83 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  24.64 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  25.74 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1175  band 7 protein  25.3 
 
 		 350 aa  46.6  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  24.39 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54960  predicted protein  25.32 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  28.5 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  26.37 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  20 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08236  hypothetical protein  21.34 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  24.86 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  22.46 
 
 		 268 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>