99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0033 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  100 
 
 		 348 aa  690    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  95.4 
 
 		 661 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  84.77 
 
 		 657 aa  598  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  68.48 
 
 		 653 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  68.48 
 
 		 653 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  68.48 
 
 		 653 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  68.48 
 
 		 652 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  68.48 
 
 		 652 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  57.39 
 
 		 683 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  48.85 
 
 		 634 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  48.14 
 
 		 641 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  46.84 
 
 		 634 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  47.94 
 
 		 995 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  48.11 
 
 		 986 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  53.31 
 
 		 1053 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  43.4 
 
 		 1177 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.36 
 
 		 1011 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.36 
 
 		 1125 aa  89.4  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.9 
 
 		 465 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.46 
 
 		 425 aa  87  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  36.36 
 
 		 510 aa  85.9  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  34.32 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  34.91 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  34.91 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.65 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.1 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  36.17 
 
 		 974 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  28.9 
 
 		 1028 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  37.86 
 
 		 954 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.71 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  36.76 
 
 		 998 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  36.76 
 
 		 949 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  36.76 
 
 		 970 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  36.76 
 
 		 970 aa  77.4  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  30.27 
 
 		 1055 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  33.18 
 
 		 965 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2001  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.2 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  35.29 
 
 		 909 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  28.45 
 
 		 947 aa  70.5  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  28.74 
 
 		 1004 aa  69.7  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  28 
 
 		 1038 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  34.04 
 
 		 942 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  36.24 
 
 		 1530 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.43 
 
 		 915 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.97 
 
 		 913 aa  60.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  27.73 
 
 		 1033 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.1 
 
 		 910 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  39.32 
 
 		 3322 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.09 
 
 		 1532 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  39.64 
 
 		 2057 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  35.22 
 
 		 1446 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  35.37 
 
 		 1325 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2218  hypothetical protein  37.01 
 
 		 709 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  49.23 
 
 		 2642 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  41.07 
 
 		 1882 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.04 
 
 		 926 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4861  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.41 
 
 		 472 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  59.18 
 
 		 1357 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  55 
 
 		 1741 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  37.39 
 
 		 1113 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  37.9 
 
 		 2003 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  34.38 
 
 		 2906 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.25 
 
 		 906 aa  50.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  30 
 
 		 422 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  35.4 
 
 		 2711 aa  49.7  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  33.86 
 
 		 1971 aa  49.7  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  41.57 
 
 		 3506 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  35.77 
 
 		 2926 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  35.83 
 
 		 1006 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  36.5 
 
 		 852 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  36 
 
 		 1550 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  35.59 
 
 		 994 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  37.7 
 
 		 2396 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  44.44 
 
 		 2365 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  48.65 
 
 		 2346 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.22 
 
 		 1285 aa  47.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  38.62 
 
 		 1806 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  61.9 
 
 		 950 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  50 
 
 		 1782 aa  46.6  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  48.05 
 
 		 2366 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  34.65 
 
 		 911 aa  46.2  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  34.48 
 
 		 2578 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  36.29 
 
 		 1508 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  40.28 
 
 		 1632 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0614  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.56 
 
 		 36805 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.74 
 
 		 1081 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  36.72 
 
 		 1459 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1881 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  42.25 
 
 		 861 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36.7 
 
 		 2363 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.66 
 
 		 1055 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  46.3 
 
 		 1848 aa  43.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  52.46 
 
 		 2371 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.32 
 
 		 1953 aa  43.1  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  50 
 
 		 1078 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  34.25 
 
 		 1108 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  35.11 
 
 		 1119 aa  42.7  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  46.67 
 
 		 3015 aa  42.7  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  37.93 
 
 		 1571 aa  42.7  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>