12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5300 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1660  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5300  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0827  putative transmembrane protein  51.85 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0898  hypothetical protein  56.52 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318072  normal  0.671417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0214  hypothetical protein  41.94 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.508022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3439  hypothetical protein  39.62 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000000342472  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4928  hypothetical protein  39.62 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000124086  normal  0.0470528 
 
 
 
NC_010515  Bcenmc03_5359  hypothetical protein  39.62 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208864  normal  0.10332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0130  hypothetical protein  37.1 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0763  hypothetical protein  43.48 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00564104  hitchhiker  0.0000763361 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2801  hypothetical protein  45.31 
 
 		 70 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1984  hypothetical protein  45.24 
 
 		 55 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>