More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5098 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  94.74 
 
 
456 aa  838  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  9.553e-07 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  70.55 
 
 
465 aa  654  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
456 aa  919  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  70.55 
 
 
465 aa  654  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  70.52 
 
 
465 aa  653  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  69.08 
 
 
466 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  59.82 
 
 
463 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  61.98 
 
 
465 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  57.39 
 
 
462 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  58.73 
 
 
461 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.29 
 
 
461 aa  405  1e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.72 
 
 
467 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.36 
 
 
467 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 
462 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  44.32 
 
 
463 aa  358  1e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 
463 aa  337  4e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
445 aa  332  7e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.5 
 
 
446 aa  329  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
449 aa  328  2e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 
450 aa  327  4e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 
450 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 
467 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
458 aa  317  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
468 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
468 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
468 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
468 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
469 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
467 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
477 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  35.37 
 
 
482 aa  292  8e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  35.79 
 
 
482 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  39.35 
 
 
470 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 
455 aa  292  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  36 
 
 
482 aa  290  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
480 aa  290  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  35.94 
 
 
480 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  35.16 
 
 
482 aa  289  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  35.16 
 
 
482 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
475 aa  287  3e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
473 aa  285  1e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  38.68 
 
 
431 aa  284  2e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  36.44 
 
 
446 aa  283  3e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  35.04 
 
 
475 aa  283  4e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  39.34 
 
 
443 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  38.51 
 
 
455 aa  279  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  38.9 
 
 
443 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  37.8 
 
 
459 aa  262  9e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
461 aa  260  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  33.06 
 
 
491 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
480 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  33.2 
 
 
491 aa  255  1e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  32.72 
 
 
491 aa  254  2e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
480 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  33.92 
 
 
468 aa  250  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
466 aa  246  7e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
477 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 
472 aa  234  2e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
462 aa  234  2e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 
472 aa  234  2e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 
472 aa  234  2e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  43.42 
 
 
472 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  5.76677e-06 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  34.09 
 
 
465 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.44 
 
 
469 aa  226  5e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
487 aa  226  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.77 
 
 
468 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
458 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
460 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
493 aa  223  5e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  32.69 
 
 
483 aa  223  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
493 aa  221  2e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  38.82 
 
 
460 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
460 aa  220  4e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  32.47 
 
 
484 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
481 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  32.47 
 
 
484 aa  219  9e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  39.16 
 
 
463 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
486 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
471 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  33.05 
 
 
464 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  38.49 
 
 
454 aa  217  3e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  35.38 
 
 
472 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  36.71 
 
 
463 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  39.07 
 
 
436 aa  215  1e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  38.2 
 
 
471 aa  214  2e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
477 aa  214  3e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
470 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 
465 aa  213  8e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  32.39 
 
 
476 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
476 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
447 aa  211  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
477 aa  210  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
489 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  37.85 
 
 
454 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
474 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
482 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
469 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
474 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  31.77 
 
 
477 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
472 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>