78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5071 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_5071  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 136 aa  263  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  41.38 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  52.17 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  43.84 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  41.38 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  52.22 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44930  hypothetical protein  51.25 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00624733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2496  PAAR motif-containing protein  41.38 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.433555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1531  PAAR motif-containing protein  42.07 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2104  PAAR motif-containing protein  40.97 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2340  PAAR motif-containing protein  40.85 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2381  PAAR motif-containing protein  41.38 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2330  PAAR motif-containing protein  40.97 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  47.06 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1928  PAAR motif-containing protein  40.14 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1554  PAAR motif-containing protein  40.14 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1728  PAAR motif-containing protein  40.14 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0609  PAAR motif-containing protein  40.28 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0546  hypothetical protein  40.28 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1327  PAAR motif-containing protein  40.28 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620595  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  40.57 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  43.53 
 
 		 173 aa  67  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  46.15 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  42.53 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  36.03 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  40.7 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  44.19 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  40.96 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  46.07 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  47.06 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  41.77 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  47.44 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1603  PAAR motif-containing protein  47.06 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0657  PAAR motif-containing protein  47.06 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1577  PAAR motif-containing protein  47.06 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1375  PAAR motif-containing protein  47.06 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.573546  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0500  hypothetical protein  47.06 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2706  PAAR motif-containing protein  48.24 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61171  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  41.38 
 
 		 92 aa  57  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  45.57 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  33.6 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  38.55 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  39.08 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1677  PAAR repeat-containing protein  37.78 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954396  hitchhiker  0.00616072 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  41.98 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  38.2 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3483  PAAR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22158  normal  0.485236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5197  hypothetical protein  38.02 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  36.96 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  43.37 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  34.07 
 
 		 453 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  39.24 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  33.05 
 
 		 615 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3641  GP29  44.16 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  39.24 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  34.57 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  38.46 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  41.67 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  41.67 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  37.97 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0051  hypothetical protein  46 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0341142  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2227  PAAR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798766  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2741  hypothetical protein  34.07 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5365  GP29  34.18 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  35.9 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4102  hypothetical protein  42.5 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4517  PAAR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  40.48 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  39.73 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  39.73 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  39.73 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0734  GP29  37.97 
 
 		 86 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  39.47 
 
 		 88 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>