120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5058 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  67.7 
 
 		 2751 aa  2921    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  69.13 
 
 		 2691 aa  2391    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  37.18 
 
 		 2737 aa  879    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  100 
 
 		 2786 aa  5411    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  39.4 
 
 		 2536 aa  1140    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  33.05 
 
 		 3929 aa  681    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2928  adhesin  40.67 
 
 		 1035 aa  552  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0157  adhesin HecA  32.5 
 
 		 2204 aa  492  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.76 
 
 		 2666 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  35.42 
 
 		 1841 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.95 
 
 		 2847 aa  384  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.11 
 
 		 2818 aa  383  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2923  hypothetical protein  37.12 
 
 		 761 aa  200  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  34.69 
 
 		 2827 aa  187  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  30.47 
 
 		 3131 aa  176  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  29.98 
 
 		 3147 aa  176  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  30.47 
 
 		 3144 aa  176  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  30.3 
 
 		 3141 aa  173  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  28.65 
 
 		 3159 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.82 
 
 		 2421 aa  167  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.09 
 
 		 3602 aa  165  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  28.75 
 
 		 3322 aa  161  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  27.63 
 
 		 3004 aa  156  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  26.76 
 
 		 2758 aa  153  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.87 
 
 		 3079 aa  153  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.94 
 
 		 3128 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.02 
 
 		 2600 aa  151  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  35.21 
 
 		 1489 aa  149  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  27.29 
 
 		 3443 aa  148  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.45 
 
 		 3967 aa  147  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  28.19 
 
 		 2588 aa  146  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  26.67 
 
 		 3350 aa  145  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.66 
 
 		 3040 aa  145  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  28.09 
 
 		 2530 aa  144  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.94 
 
 		 2545 aa  144  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  29.96 
 
 		 3501 aa  143  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  29.81 
 
 		 3552 aa  143  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  29.32 
 
 		 2984 aa  142  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.56 
 
 		 2345 aa  141  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  31.17 
 
 		 1998 aa  140  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  32.56 
 
 		 3141 aa  139  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  32.56 
 
 		 3141 aa  139  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  27.1 
 
 		 3563 aa  135  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  28.43 
 
 		 3165 aa  135  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  31.44 
 
 		 5212 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.86 
 
 		 3475 aa  134  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.84 
 
 		 3020 aa  133  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  32.68 
 
 		 4966 aa  133  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.45 
 
 		 658 aa  132  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4486  metalloendopeptidase  43.48 
 
 		 306 aa  132  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.604115  normal  0.0822021 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  31.21 
 
 		 2449 aa  131  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  35.15 
 
 		 594 aa  131  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.64 
 
 		 1730 aa  131  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.67 
 
 		 3028 aa  129  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.1 
 
 		 3480 aa  127  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.1 
 
 		 3378 aa  128  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  31.32 
 
 		 1651 aa  127  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.32 
 
 		 2782 aa  125  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  27.42 
 
 		 3081 aa  125  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.29 
 
 		 3790 aa  125  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26 
 
 		 2670 aa  124  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.23 
 
 		 3884 aa  124  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  32.45 
 
 		 3526 aa  123  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.84 
 
 		 1508 aa  122  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  32.92 
 
 		 1270 aa  122  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.15 
 
 		 1508 aa  120  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.01 
 
 		 3796 aa  120  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.5 
 
 		 3785 aa  120  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  31.3 
 
 		 3301 aa  120  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.9 
 
 		 5981 aa  120  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.15 
 
 		 1508 aa  118  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_003296  RS02096  hypothetical protein  81.25 
 
 		 75 aa  117  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0983188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.34 
 
 		 1723 aa  114  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  27.55 
 
 		 812 aa  113  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.6 
 
 		 1508 aa  111  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5359  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.69 
 
 		 678 aa  104  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.627453 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  26.16 
 
 		 1745 aa  102  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  31.6 
 
 		 1635 aa  101  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6763  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.04 
 
 		 678 aa  99.8  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198523  normal  0.504968 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.12 
 
 		 721 aa  98.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  27.44 
 
 		 898 aa  97.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  27.85 
 
 		 905 aa  97.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  27.85 
 
 		 905 aa  97.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  28.37 
 
 		 914 aa  97.1  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  27.85 
 
 		 911 aa  97.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2341  hemagglutinin-like protein  28.05 
 
 		 901 aa  96.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.09 
 
 		 1615 aa  96.3  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.25 
 
 		 923 aa  96.3  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0801  hemagglutinin, homlog  27.24 
 
 		 893 aa  95.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  31.54 
 
 		 1618 aa  94  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7339  adhesin HecA  52.44 
 
 		 515 aa  89  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.991029  normal  0.53872 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4028  adhesin HecA family  24.11 
 
 		 2964 aa  88.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  22.15 
 
 		 2651 aa  88.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7335  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.23 
 
 		 681 aa  86.7  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.989933  normal  0.505585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.54 
 
 		 428 aa  84.7  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5056  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.47 
 
 		 847 aa  84.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776969  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  31.37 
 
 		 846 aa  82.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  26.81 
 
 		 1719 aa  82.4  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04813  hemagglutinin-like signal peptide protein  32.01 
 
 		 846 aa  81.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.565889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  27.7 
 
 		 2350 aa  81.3  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>