194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5012 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_5012  helicase domain protein  100 
 
 		 1055 aa  2186    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.87 
 
 		 1028 aa  75.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  21.37 
 
 		 1006 aa  74.3  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  24.47 
 
 		 663 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  24.66 
 
 		 773 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  25.46 
 
 		 990 aa  72.4  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  21.83 
 
 		 1185 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  21.58 
 
 		 918 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  21.58 
 
 		 918 aa  68.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  21.31 
 
 		 918 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  21.08 
 
 		 918 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  22.8 
 
 		 977 aa  67.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  21.31 
 
 		 918 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  21.31 
 
 		 918 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  21.31 
 
 		 918 aa  67  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  21.31 
 
 		 918 aa  67  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  21.65 
 
 		 1125 aa  66.6  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  21.08 
 
 		 918 aa  67.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  22.24 
 
 		 892 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  20.78 
 
 		 1072 aa  66.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  22.68 
 
 		 903 aa  65.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  22.75 
 
 		 917 aa  65.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  22.36 
 
 		 1152 aa  65.9  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  20.81 
 
 		 918 aa  65.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  21.96 
 
 		 1178 aa  65.5  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  22.51 
 
 		 899 aa  65.5  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  21.7 
 
 		 886 aa  64.7  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  21.45 
 
 		 1175 aa  64.7  0.000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  23.68 
 
 		 1130 aa  64.7  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  23.06 
 
 		 1194 aa  63.9  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  21.79 
 
 		 1078 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  22.22 
 
 		 1048 aa  64.3  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.88 
 
 		 1007 aa  64.3  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.07 
 
 		 1155 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.73 
 
 		 895 aa  63.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.86 
 
 		 1129 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  23.85 
 
 		 1143 aa  63.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  22.4 
 
 		 988 aa  63.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  24.89 
 
 		 1084 aa  63.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  20.98 
 
 		 918 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.65 
 
 		 1112 aa  62.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  20.83 
 
 		 1074 aa  62.4  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  23.22 
 
 		 1110 aa  62  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  22.13 
 
 		 1354 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  25.13 
 
 		 1019 aa  62  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  22.41 
 
 		 1108 aa  62  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  27.06 
 
 		 876 aa  61.6  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  24.1 
 
 		 1040 aa  61.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  21.87 
 
 		 1134 aa  60.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  23.02 
 
 		 902 aa  61.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  23.01 
 
 		 898 aa  60.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  24.93 
 
 		 1013 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  22.1 
 
 		 617 aa  61.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  22.22 
 
 		 901 aa  60.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  21.41 
 
 		 1084 aa  60.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  30.34 
 
 		 872 aa  60.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.1 
 
 		 950 aa  60.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  21.92 
 
 		 1033 aa  59.7  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  23.77 
 
 		 1209 aa  59.7  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  21.64 
 
 		 1084 aa  59.7  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  22.39 
 
 		 958 aa  59.3  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.22 
 
 		 1048 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  23.69 
 
 		 1066 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  22.67 
 
 		 1026 aa  58.5  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  24.38 
 
 		 931 aa  58.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  30.67 
 
 		 1100 aa  58.2  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  20.41 
 
 		 1531 aa  58.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  20.84 
 
 		 1088 aa  58.2  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  22.28 
 
 		 821 aa  57.8  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  21.96 
 
 		 1050 aa  58.2  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  23.89 
 
 		 1102 aa  58.2  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  21.26 
 
 		 1284 aa  57.4  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.57 
 
 		 1261 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  21.69 
 
 		 1003 aa  57.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  26.72 
 
 		 1096 aa  56.6  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  20.6 
 
 		 980 aa  57  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  23.62 
 
 		 1120 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  21.83 
 
 		 1019 aa  56.6  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.27 
 
 		 1029 aa  56.2  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.45 
 
 		 925 aa  56.2  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6303  helicase domain protein  22.87 
 
 		 493 aa  55.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  20.9 
 
 		 924 aa  55.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  19.47 
 
 		 933 aa  55.1  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  22.22 
 
 		 1082 aa  55.5  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  21.77 
 
 		 1070 aa  55.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  20.66 
 
 		 1007 aa  55.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  26.21 
 
 		 991 aa  55.1  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  21.28 
 
 		 1227 aa  55.5  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.85 
 
 		 1160 aa  55.5  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.19 
 
 		 982 aa  55.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  22.92 
 
 		 1086 aa  55.1  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  22.75 
 
 		 1073 aa  55.1  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  25.97 
 
 		 1159 aa  54.7  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  22.93 
 
 		 1064 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  22.82 
 
 		 1064 aa  54.3  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  22.93 
 
 		 1064 aa  54.3  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  23.39 
 
 		 1091 aa  54.3  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  22.82 
 
 		 1064 aa  54.3  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  22.54 
 
 		 1082 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.56 
 
 		 1113 aa  54.3  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>