More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4710 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  100 
 
 		 481 aa  968    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  63.46 
 
 		 445 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  36.91 
 
 		 479 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  37.5 
 
 		 470 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  38.05 
 
 		 445 aa  247  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  36.38 
 
 		 468 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  34.88 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  35.93 
 
 		 427 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  31.82 
 
 		 495 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  31.82 
 
 		 495 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  31.69 
 
 		 436 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  34.92 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  31.61 
 
 		 628 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  30.54 
 
 		 418 aa  170  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  31.42 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  31.39 
 
 		 1199 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  31.21 
 
 		 1274 aa  140  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  27.63 
 
 		 536 aa  123  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  26.76 
 
 		 425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  26.98 
 
 		 494 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  35 
 
 		 999 aa  110  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  25.19 
 
 		 657 aa  110  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  28.32 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  24.71 
 
 		 577 aa  109  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  26.68 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  32.96 
 
 		 407 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  27.93 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  26.73 
 
 		 422 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  26.67 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  29.06 
 
 		 474 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  25.65 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  26.88 
 
 		 442 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  27.25 
 
 		 458 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  26.63 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  24.41 
 
 		 565 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  26.71 
 
 		 496 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  24.53 
 
 		 478 aa  97.1  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  24.53 
 
 		 478 aa  97.1  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  25.62 
 
 		 456 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  27.11 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  24.89 
 
 		 459 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  27.75 
 
 		 422 aa  95.9  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  24.62 
 
 		 619 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  26 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  23.29 
 
 		 592 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  24.52 
 
 		 616 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  23.97 
 
 		 619 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  28.36 
 
 		 480 aa  93.6  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  28.95 
 
 		 419 aa  93.6  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  24.46 
 
 		 492 aa  92  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  23.73 
 
 		 456 aa  92.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  30 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  27.76 
 
 		 429 aa  92.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  26.56 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  28.89 
 
 		 476 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  26.38 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  26.54 
 
 		 436 aa  91.3  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  25.16 
 
 		 624 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  24.63 
 
 		 625 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  26.16 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  26.21 
 
 		 469 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  27.07 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  26.51 
 
 		 485 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  24.83 
 
 		 445 aa  86.7  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  24.57 
 
 		 422 aa  86.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  23.83 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  24.34 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  26.94 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  26.16 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  28.29 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  23.67 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  23.68 
 
 		 482 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  26.87 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  25.94 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  23.86 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  26.34 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  25.56 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  27.67 
 
 		 450 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  21.75 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  24.63 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  25.73 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  26.13 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  23.25 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  25.27 
 
 		 600 aa  78.2  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  25.69 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  25.42 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  24.67 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  22.67 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  23.19 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  24.61 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.61 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  25.19 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  23.27 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  23.87 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  24.69 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  23.47 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  24.2 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  23.62 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  22.49 
 
 		 469 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  23.47 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>