18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4678 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4678  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 184 aa  376  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  36.36 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4663  putative neutral zinc metallopeptidase  38.85 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.0769861 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  32.2 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  30.77 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  41.94 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  30.89 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  40 
 
 		 425 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0781  hypothetical protein  32.04 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  30.47 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  35.87 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3077  protein of unknown function DUF955  29.93 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2058  protein of unknown function DUF955  30.25 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000868136  normal  0.0120783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  26.38 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2995  hypothetical protein  25 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0183  hypothetical protein  30 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  35 
 
 		 435 aa  42.4  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  35 
 
 		 435 aa  42.4  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>