19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4677 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4677  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 120 aa  243  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  38.84 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1891  XRE family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  37.61 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  47.13 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  47.13 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3114  XRE family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1245  XRE family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.664422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3488  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4662  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.700483  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0985  DNA binding protein  33.91 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123712  unclonable  0.0000012964 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0253  hypothetical protein  30.09 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  31.63 
 
 		 457 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3601  XRE family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000201761  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  34.78 
 
 		 281 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>