25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4601 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_003296  RS01895  putative transmembrane protein  65.76 
 
 		 188 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0216755  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  35.98 
 
 		 199 aa  95.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  35.48 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  38.82 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  35.71 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  38.46 
 
 		 188 aa  89  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  35.91 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  36.99 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  38.78 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  35.39 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  31.12 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  35.76 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  32.63 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  30.06 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  27.75 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5029  putative transmembrane protein  29.79 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313273  normal  0.903322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  29.24 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  28.1 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  28.1 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  26.25 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  26.14 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  26.29 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>