More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4570 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4570  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  100 
 
 		 336 aa  678    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0690283  normal  0.180174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4437  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  100 
 
 		 336 aa  678    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1505  alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  82.07 
 
 		 334 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4710  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  70.69 
 
 		 331 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1844  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  66.36 
 
 		 328 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.364019  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4279  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  68 
 
 		 329 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5774  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  66.97 
 
 		 328 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5905  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  67.28 
 
 		 329 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.22496 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0056  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  64.22 
 
 		 329 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3811  alcohol dehydrogenase  67.08 
 
 		 329 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.367901  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6316  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.53 
 
 		 328 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2263  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  64.62 
 
 		 328 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0163  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  67.28 
 
 		 328 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1018  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  67.28 
 
 		 328 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2748  putative oxidoreductase  67.28 
 
 		 328 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2605  putative oxidoreductase  67.28 
 
 		 328 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1333  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  67.28 
 
 		 328 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0189  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  67.28 
 
 		 328 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  63.44 
 
 		 338 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0778  alcohol dehydrogenase  61.93 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0909  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  63.19 
 
 		 328 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.543563  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0046  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  61.4 
 
 		 336 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0459  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  66.97 
 
 		 328 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3850  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  62.65 
 
 		 324 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1412  alcohol dehydrogenase  63 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2442  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.3 
 
 		 332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00520029 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4129  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  62.46 
 
 		 328 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2010  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  63.08 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64 
 
 		 327 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1118  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.35 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.439125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0378  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.62 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1418  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.69 
 
 		 327 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5710  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.31 
 
 		 328 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3003  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.05 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4206  alcohol dehydrogenase  60.62 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00880  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  60.62 
 
 		 327 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2088  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.69 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.69 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0255685 
 
 
-
 
NC_004310  BR1061  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.69 
 
 		 327 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215754  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4482  alcohol dehydrogenase  58.15 
 
 		 328 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3463  alcohol dehydrogenase  60.55 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1916  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.2 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0116  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.94 
 
 		 327 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1026  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.69 
 
 		 327 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1937  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.21 
 
 		 344 aa  388  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3411  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.51 
 
 		 341 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0749603  normal  0.0972256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5373  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.52 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0573  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  63 
 
 		 330 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.526868  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2413  hypothetical protein  56 
 
 		 328 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5755  putative alcohol dehydrogenase  59.08 
 
 		 329 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2558  hypothetical protein  55.69 
 
 		 328 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1201  putative alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  60.24 
 
 		 329 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2299  alcohol dehydrogenase  57.4 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2296  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.03 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277676  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  57.32 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2614  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.54 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6106  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.31 
 
 		 326 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0426  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.23 
 
 		 327 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5387  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60 
 
 		 326 aa  351  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.79 
 
 		 331 aa  342  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.85 
 
 		 304 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0181  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase (ADH-HT). oxidoreductase protein  84.04 
 
 		 188 aa  328  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.103574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0343  alcohol dehydrogenase  52.17 
 
 		 333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0138  alcohol dehydrogenase  51.74 
 
 		 337 aa  305  7e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1192  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.75 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0303  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  44.74 
 
 		 332 aa  298  8e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0829  alcohol dehydrogenase  47.9 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2709  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2022  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  51.25 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000478739  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3073  alcohol dehydrogenase  49.23 
 
 		 333 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6571  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  47.38 
 
 		 358 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0264  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.94 
 
 		 332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1330  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4103  putative alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.409258  normal  0.240324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3343  alcohol dehydrogenase  47.81 
 
 		 332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0866379 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 		 348 aa  266  4e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.2 
 
 		 323 aa  259  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1805  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.05 
 
 		 332 aa  255  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1124  alcohol dehydrogenase  47.84 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1096  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.84 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1113  alcohol dehydrogenase  47.84 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11890  alcohol dehydrogenase adhA  45.23 
 
 		 346 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.594038 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0630  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  37.21 
 
 		 344 aa  246  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0775  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.81 
 
 		 342 aa  223  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1084  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  35.28 
 
 		 342 aa  198  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.31  normal  0.438887 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  38.79 
 
 		 341 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.88 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 		 344 aa  182  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  34.87 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.13 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.82 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.82 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.84 
 
 		 335 aa  176  5e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.57 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>