138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4558 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
378 aa  757    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
378 aa  757    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  79.58 
 
 
398 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  75.66 
 
 
378 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  74.07 
 
 
378 aa  591  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  73.02 
 
 
378 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  73.81 
 
 
378 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  73.02 
 
 
378 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  73.02 
 
 
378 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  73.02 
 
 
378 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  73.02 
 
 
378 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  72.49 
 
 
378 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  73.02 
 
 
378 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  71.16 
 
 
384 aa  567  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  68.78 
 
 
378 aa  560  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  61.1 
 
 
378 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  61.1 
 
 
378 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  53.97 
 
 
380 aa  427  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  55.11 
 
 
380 aa  413  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  36.04 
 
 
366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  35.57 
 
 
380 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  33.86 
 
 
380 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  32.9 
 
 
386 aa  204  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  33.93 
 
 
382 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  32.37 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1398  protein of unknown function DUF214  33.15 
 
 
397 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00210458  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  29.35 
 
 
376 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  25.93 
 
 
374 aa  105  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 
372 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  25.64 
 
 
410 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  25.71 
 
 
377 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.2 
 
 
375 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  25.59 
 
 
376 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  23.52 
 
 
415 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  23.42 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  23.69 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  23.29 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  24.68 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  24.81 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  31.58 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  24.23 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  23.43 
 
 
397 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  24.36 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  24.5 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  21.66 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  23.08 
 
 
389 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  29.05 
 
 
385 aa  62.8  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  22.89 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  23.35 
 
 
414 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  27.08 
 
 
385 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  24.33 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  22.25 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.29 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  25.19 
 
 
383 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  25.19 
 
 
383 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  30.82 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  25.12 
 
 
385 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  22.82 
 
 
389 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  22.68 
 
 
397 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  25.41 
 
 
349 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  21.41 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  22.19 
 
 
384 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  23.7 
 
 
389 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  21.3 
 
 
390 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.06 
 
 
397 aa  57  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  23.86 
 
 
397 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  22.39 
 
 
392 aa  56.6  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  21.48 
 
 
390 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  25.97 
 
 
388 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  28.38 
 
 
362 aa  55.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  21.55 
 
 
397 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  21.04 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  22.73 
 
 
402 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  24.28 
 
 
377 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  28 
 
 
395 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  22.59 
 
 
400 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  23.34 
 
 
397 aa  53.1  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  22.98 
 
 
390 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  21.48 
 
 
390 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  19.66 
 
 
406 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  22.73 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  24.44 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  24 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  21.27 
 
 
397 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  21.69 
 
 
401 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  22.9 
 
 
380 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  26.1 
 
 
355 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  22.85 
 
 
398 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  25.17 
 
 
414 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  25.17 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  21.52 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  22.87 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0856  ABC transporter, permease protein, putative  22.6 
 
 
407 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0945492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  28.8 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  23.75 
 
 
687 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  23.33 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  22.41 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>