More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4557 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4424  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  470  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.056527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4557  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  470  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0557853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  76.96 
 
 		 232 aa  364  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  75.65 
 
 		 232 aa  353  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2768  ABC transporter, ATP-binding protein  74.78 
 
 		 234 aa  348  6e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2625  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  74.78 
 
 		 234 aa  348  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1033  ABC transporter, ATP-binding protein  74.78 
 
 		 232 aa  347  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5887  ABC transporter related  73.91 
 
 		 232 aa  347  8e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0173  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  74.35 
 
 		 234 aa  345  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1318  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  74.35 
 
 		 234 aa  345  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0147  ABC transporter, ATP-binding protein  74.35 
 
 		 232 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5591  ABC transporter related  71.98 
 
 		 232 aa  343  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0559495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7010  ABC transporter related  72.61 
 
 		 232 aa  343  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0349987  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  70.18 
 
 		 231 aa  335  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1294  ABC transporter related  68.53 
 
 		 234 aa  335  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0101  ABC transporter, ATP-binding protein  67.43 
 
 		 230 aa  296  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0103  ABC transporter related  67.43 
 
 		 230 aa  296  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0009  ABC transporter related  57.73 
 
 		 235 aa  267  8e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406325  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0312  ABC transporter related  52.97 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.403569  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  43.81 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  46.19 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  44.64 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  45.37 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  44.64 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  43.24 
 
 		 240 aa  185  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1116  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  46.82 
 
 		 241 aa  179  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  41.67 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  42.6 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  43.38 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  43.64 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  40.54 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  41.1 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  40.45 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  42.59 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.72 
 
 		 242 aa  175  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  45.05 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  42.65 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  41.74 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  40.18 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  40.91 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  42.6 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  42.6 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  39.91 
 
 		 236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  41.15 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  40.71 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  42.04 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  40.36 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  45.62 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  42.6 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  44.55 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3339  ABC transporter related  39.19 
 
 		 249 aa  171  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1641  ABC transporter related  40.45 
 
 		 254 aa  171  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  43.69 
 
 		 249 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  38.64 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  43.95 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  42.47 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  44.08 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1234  ABC transporter-like  40.62 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  44.29 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  40.93 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  45 
 
 		 298 aa  169  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  41.18 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  42.47 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  40.81 
 
 		 223 aa  169  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  40.93 
 
 		 235 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  40.1 
 
 		 217 aa  169  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  40.47 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  42.65 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  40.47 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  42.13 
 
 		 232 aa  168  8e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  40.83 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 240 aa  167  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  40.87 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  42.13 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  40.87 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  41.55 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  38.84 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  43.95 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  39.44 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.27 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  39.44 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  40.18 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  38.77 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  38.57 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  44.09 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 240 aa  165  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>