125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4549 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  100 
 
 		 516 aa  1043    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  100 
 
 		 516 aa  1043    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  55.71 
 
 		 497 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  54.49 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  45.77 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  41.05 
 
 		 527 aa  350  5e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  41.33 
 
 		 544 aa  335  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  41.2 
 
 		 520 aa  329  6e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  42.06 
 
 		 509 aa  326  6e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  39.02 
 
 		 518 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  42.92 
 
 		 482 aa  317  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  42.42 
 
 		 520 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  38.31 
 
 		 551 aa  312  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  37.69 
 
 		 533 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  37.57 
 
 		 516 aa  311  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  39.57 
 
 		 508 aa  311  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  37.31 
 
 		 520 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  38.75 
 
 		 518 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  40.95 
 
 		 535 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  36.87 
 
 		 540 aa  305  9.000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  37.91 
 
 		 556 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  37.6 
 
 		 520 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  38.88 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  38.45 
 
 		 513 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  37.09 
 
 		 512 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3305  hypothetical protein  39.08 
 
 		 537 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  37.08 
 
 		 526 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  41.68 
 
 		 498 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  39.71 
 
 		 514 aa  297  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  37.75 
 
 		 518 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  39.88 
 
 		 533 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  39.92 
 
 		 506 aa  295  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  37.01 
 
 		 530 aa  295  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  37.07 
 
 		 520 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13151  hypothetical protein  36.58 
 
 		 556 aa  293  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.309836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  37.2 
 
 		 502 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  42.13 
 
 		 523 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  39.41 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  40.08 
 
 		 509 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  36.9 
 
 		 520 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  39.58 
 
 		 516 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  40.91 
 
 		 523 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  33.01 
 
 		 510 aa  273  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  34.15 
 
 		 513 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  33.95 
 
 		 513 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  35.11 
 
 		 523 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  34.07 
 
 		 508 aa  269  7e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  34.42 
 
 		 522 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  37.88 
 
 		 579 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  37.7 
 
 		 549 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3211  hypothetical protein  40.04 
 
 		 603 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1424  hypothetical protein  39.68 
 
 		 569 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  32.46 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3085  hypothetical protein  39.68 
 
 		 603 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2028  hypothetical protein  38.65 
 
 		 600 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1052  hypothetical protein  38.65 
 
 		 600 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1338  hypothetical protein  38.65 
 
 		 600 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2318  hypothetical protein  38.65 
 
 		 600 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469586  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5918  hypothetical protein  39.92 
 
 		 536 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.571754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1915  hypothetical protein  34.25 
 
 		 526 aa  239  8e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294472  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  39.53 
 
 		 526 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  38.98 
 
 		 524 aa  237  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6183  hypothetical protein  39.8 
 
 		 514 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.433204 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  36 
 
 		 517 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2314  hypothetical protein  37.65 
 
 		 613 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  36.06 
 
 		 518 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  31.03 
 
 		 520 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 		 518 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2603  hypothetical protein  37.15 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  35.44 
 
 		 528 aa  217  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  31.03 
 
 		 519 aa  216  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  30.1 
 
 		 520 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4047  hypothetical protein  33.26 
 
 		 526 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  34.41 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5756  hypothetical protein  35 
 
 		 518 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4721  hypothetical protein  35.95 
 
 		 519 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358451  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0148  hypothetical protein  34.41 
 
 		 514 aa  206  7e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  32.11 
 
 		 525 aa  204  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0668  hypothetical protein  33.4 
 
 		 544 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2221  hypothetical protein  36.32 
 
 		 520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  35.28 
 
 		 521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  27.61 
 
 		 520 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  27.8 
 
 		 520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  34.3 
 
 		 518 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0661  aminoglycoside phosphotransferase  34.86 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0314986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  35.35 
 
 		 499 aa  193  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  30.51 
 
 		 527 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2122  hypothetical protein  35.64 
 
 		 505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2392  kinase-like protein  34.94 
 
 		 505 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42432  normal  0.238047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0470  hypothetical protein  35.16 
 
 		 505 aa  190  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6097  hypothetical protein  36.99 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2984  hypothetical protein  40.85 
 
 		 345 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  30.83 
 
 		 521 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  34.2 
 
 		 512 aa  184  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3997  aminoglycoside phosphotransferase  31.11 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  30.1 
 
 		 529 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6932  hypothetical protein  32.63 
 
 		 523 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  31.3 
 
 		 525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  30.11 
 
 		 533 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2266  hypothetical protein  31.04 
 
 		 338 aa  160  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>