84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4547 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  100 
 
 		 217 aa  440  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  440  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  66.51 
 
 		 305 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  66.51 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  66.51 
 
 		 217 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  66.51 
 
 		 217 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  66.51 
 
 		 217 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  66.51 
 
 		 217 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  66.51 
 
 		 217 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  64.62 
 
 		 221 aa  277  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  65.58 
 
 		 217 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  61.97 
 
 		 249 aa  268  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  62.26 
 
 		 221 aa  265  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  61.14 
 
 		 222 aa  258  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  57.21 
 
 		 222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  54.46 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  51.87 
 
 		 247 aa  185  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  51.24 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  51.24 
 
 		 232 aa  177  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  51.79 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  50.54 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  49.21 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  48.91 
 
 		 282 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  43.09 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  37.57 
 
 		 202 aa  121  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  41.81 
 
 		 254 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  38.42 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  36.51 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  33.04 
 
 		 274 aa  102  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  32.34 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  33.33 
 
 		 235 aa  95.5  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  32.08 
 
 		 234 aa  95.1  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  32.35 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  35.57 
 
 		 202 aa  92.4  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  32 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  31.91 
 
 		 189 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  32.02 
 
 		 237 aa  88.6  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  27.92 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  32.84 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  35.27 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  28.79 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  27.37 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  30.23 
 
 		 382 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  31.82 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  29.84 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  28.41 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  29.05 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.32 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  29.94 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  28.74 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  30.63 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  27.51 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  26.32 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  27.23 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  28.57 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  28.34 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  25.58 
 
 		 371 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  31.25 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  27.53 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  35.71 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  29.22 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  28.64 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  28.57 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  27.57 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  38.68 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  28.19 
 
 		 251 aa  48.9  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  28.17 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  27.15 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  36.05 
 
 		 474 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  27.15 
 
 		 356 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  28.12 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  33.33 
 
 		 475 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.39 
 
 		 341 aa  45.4  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  27.27 
 
 		 473 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  24.84 
 
 		 470 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  23 
 
 		 3739 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  34.58 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  27.04 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  24.84 
 
 		 470 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  24.84 
 
 		 470 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  29.17 
 
 		 1514 aa  42.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  26.67 
 
 		 471 aa  42.4  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  36.36 
 
 		 2454 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  31.03 
 
 		 236 aa  42  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>