More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4513 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  90.02 
 
 
452 aa  813    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  70.13 
 
 
452 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
454 aa  928    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
454 aa  928    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  62.61 
 
 
452 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  55.43 
 
 
452 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  55.19 
 
 
453 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  53.42 
 
 
454 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  55.31 
 
 
455 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  54.2 
 
 
455 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  54.32 
 
 
452 aa  497  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  54.2 
 
 
455 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  53.74 
 
 
455 aa  495  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  51.11 
 
 
470 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  55.28 
 
 
453 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  53.98 
 
 
452 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  52.55 
 
 
452 aa  484  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  52.43 
 
 
470 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  52.2 
 
 
472 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  51.98 
 
 
459 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  50 
 
 
452 aa  478  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  50.22 
 
 
452 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  52.54 
 
 
468 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  51.98 
 
 
472 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  51.98 
 
 
472 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  52.2 
 
 
603 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  51.21 
 
 
467 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  52.86 
 
 
589 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  51.98 
 
 
472 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  51.88 
 
 
455 aa  476  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  53.05 
 
 
473 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  50.55 
 
 
452 aa  465  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  50.66 
 
 
454 aa  461  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  50.78 
 
 
452 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  50.78 
 
 
472 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  48.57 
 
 
453 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  50.67 
 
 
454 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  50 
 
 
454 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  50.55 
 
 
477 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  50.22 
 
 
457 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  51.54 
 
 
468 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  50.44 
 
 
454 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  50.44 
 
 
454 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  48.56 
 
 
461 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  49.45 
 
 
454 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  49.45 
 
 
454 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  48.8 
 
 
460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  48.69 
 
 
460 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  48.47 
 
 
460 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  47.93 
 
 
461 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  45.85 
 
 
460 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  42.48 
 
 
451 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  38.72 
 
 
476 aa  362  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.65 
 
 
525 aa  352  7e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  42.44 
 
 
524 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.66 
 
 
536 aa  346  4e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  39.23 
 
 
469 aa  345  8.999999999999999e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.9 
 
 
543 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  39.66 
 
 
522 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  37.77 
 
 
467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.27 
 
 
530 aa  339  7e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  41.47 
 
 
470 aa  335  9e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  36.83 
 
 
468 aa  335  1e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  41.14 
 
 
469 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.72 
 
 
464 aa  333  4e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.25 
 
 
471 aa  332  8e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  37.27 
 
 
468 aa  332  9e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  40.34 
 
 
535 aa  331  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  39 
 
 
525 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.82 
 
 
541 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.88 
 
 
470 aa  323  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.47 
 
 
540 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  42.18 
 
 
467 aa  318  9e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  40.99 
 
 
465 aa  317  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  38.92 
 
 
544 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  39.96 
 
 
464 aa  317  4e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 
465 aa  316  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  39.15 
 
 
536 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  39.23 
 
 
465 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  38.6 
 
 
462 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  38.28 
 
 
467 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  38.49 
 
 
467 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  40.39 
 
 
462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  35.7 
 
 
570 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.16 
 
 
474 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.11 
 
 
490 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  37.98 
 
 
536 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  37.53 
 
 
515 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  37.47 
 
 
464 aa  303  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 
463 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.06 
 
 
481 aa  300  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  38.83 
 
 
468 aa  299  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  39.78 
 
 
542 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 
489 aa  298  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  37.78 
 
 
466 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  37.69 
 
 
467 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.18 
 
 
490 aa  296  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.21 
 
 
469 aa  296  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  39.6 
 
 
532 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  35.82 
 
 
536 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>