16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4480 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6342  antitoxin of a toxin/antitoxin system  100 
 
 		 92 aa  177  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000639771  unclonable  0.0000000491006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1478  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.690305  unclonable  0.0000000000000121771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1853  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0573834  hitchhiker  0.000000000000313336 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4480  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000118504 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2110  hypothetical protein  94.57 
 
 		 92 aa  149  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.419792  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0835  hypothetical protein  77.65 
 
 		 91 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.362102  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0844  hypothetical protein  68.48 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2782  hypothetical protein  59.34 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000931172  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2335  hypothetical protein  76.62 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3761  hypothetical protein  42.42 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.224047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4585  hypothetical protein  42.35 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0005  hypothetical protein  35.37 
 
 		 89 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0255  hypothetical protein  35.37 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.50052  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0045  hypothetical protein  32.93 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130777  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1495  hypothetical protein  37.5 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.793721  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4227  hypothetical protein  47.62 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.517904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>