More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4453 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  100 
 
 		 226 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  71.9 
 
 		 168 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  42.99 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  42.52 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  42.52 
 
 		 219 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  42.52 
 
 		 219 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  42.27 
 
 		 292 aa  175  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  40.65 
 
 		 218 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  37.56 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  37.56 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  37.56 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  39.72 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  36.67 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  43.4 
 
 		 196 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  38.61 
 
 		 200 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  38.36 
 
 		 179 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  34.62 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  34.02 
 
 		 318 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  38.04 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  34.97 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  32.77 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  35.62 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  33.14 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  33.72 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  32.95 
 
 		 205 aa  98.6  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 208 aa  98.6  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  33.74 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  35.43 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  31.61 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  38.36 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  34.66 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  34.66 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  34.66 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  34.91 
 
 		 204 aa  96.7  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  33.33 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  37.43 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  33.14 
 
 		 206 aa  95.5  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  34.88 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  36.09 
 
 		 379 aa  95.1  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  36.78 
 
 		 382 aa  94.4  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  33.9 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  32.74 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  38.18 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  33.72 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  31.25 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  35.06 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  33.14 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  34.66 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  32.39 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  32.92 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  37.2 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  33.14 
 
 		 199 aa  92.4  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  31.36 
 
 		 281 aa  92  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  33.75 
 
 		 198 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  32.16 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  35.63 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  35.63 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  36.26 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  35.63 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  35.63 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  35.63 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  35.63 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  31.84 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  34.48 
 
 		 545 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  32.37 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  32.37 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  32.77 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  33.52 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  36.97 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  35.88 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  33.91 
 
 		 373 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  34.55 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  34.5 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  35.63 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  36.57 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  33.93 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  33.92 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  32.14 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  32.96 
 
 		 206 aa  89.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  31.36 
 
 		 213 aa  89.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  31.36 
 
 		 213 aa  89.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  33.12 
 
 		 199 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  35.37 
 
 		 225 aa  88.6  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  36.97 
 
 		 267 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  36.57 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  36.57 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>