More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4413 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  72.99 
 
 		 457 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  81.51 
 
 		 467 aa  738    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 461 aa  924    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  85.43 
 
 		 461 aa  815    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  72.99 
 
 		 457 aa  675    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  73.21 
 
 		 457 aa  673    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  84.72 
 
 		 461 aa  787    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  68.48 
 
 		 477 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 461 aa  924    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  73.54 
 
 		 457 aa  678    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  78.21 
 
 		 469 aa  736    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  67.17 
 
 		 477 aa  637    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  74.07 
 
 		 468 aa  687    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  84.57 
 
 		 464 aa  798    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  79.61 
 
 		 468 aa  716    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  71.05 
 
 		 459 aa  677    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  65.73 
 
 		 477 aa  616  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  66.59 
 
 		 463 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  67.5 
 
 		 406 aa  554  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  54.08 
 
 		 456 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  49.08 
 
 		 493 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  48.29 
 
 		 453 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  47.14 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  40.18 
 
 		 458 aa  344  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  44.09 
 
 		 439 aa  340  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 468 aa  339  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 		 452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 442 aa  326  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 450 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  38.27 
 
 		 447 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  35.62 
 
 		 482 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  34.92 
 
 		 443 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  36.36 
 
 		 447 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  35.7 
 
 		 455 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  34.17 
 
 		 468 aa  250  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  35.23 
 
 		 456 aa  250  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  35.67 
 
 		 461 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  35.67 
 
 		 461 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  35.67 
 
 		 461 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.3 
 
 		 447 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  37.63 
 
 		 454 aa  246  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  32.63 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  35.27 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 439 aa  243  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 440 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  36.91 
 
 		 441 aa  240  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  33.57 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  33.57 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  33.57 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  34.49 
 
 		 432 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  36.63 
 
 		 467 aa  237  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  33.79 
 
 		 438 aa  237  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.62 
 
 		 437 aa  236  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  33.33 
 
 		 433 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.64 
 
 		 432 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  34.03 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  33.1 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  33.48 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 439 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 452 aa  233  7.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  36.12 
 
 		 456 aa  233  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  33.63 
 
 		 484 aa  233  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4107  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 458 aa  232  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  33.42 
 
 		 435 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 433 aa  232  9e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 460 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 431 aa  232  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  33.42 
 
 		 435 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  34.63 
 
 		 450 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 439 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 445 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  33.42 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  33.42 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  33.16 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  33.42 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.17 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 439 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.9 
 
 		 441 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.88 
 
 		 452 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 439 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 445 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 439 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 436 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 468 aa  230  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 439 aa  230  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  32.97 
 
 		 470 aa  230  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 445 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 445 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>