39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4367 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4367  putative lipoprotein  100 
 
 		 260 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11568  normal  0.560371 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4257  putative lipoprotein  100 
 
 		 260 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.14352 
 
 
-
 
NC_003296  RS02585  putative lipoprotein  74.11 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143555  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1662  putative signal peptide protein  42.61 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2789  putative signal peptide protein  46.73 
 
 		 242 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0031715  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0889  hypothetical protein  40.71 
 
 		 216 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1452  hypothetical protein  40.34 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1412  hypothetical protein  40.17 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0889401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2533  hypothetical protein  44.93 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0984  hypothetical protein  40.27 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295093  normal  0.1274 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1025  hypothetical protein  40.27 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0546  hypothetical protein  40.27 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4670  hypothetical protein  39.83 
 
 		 233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574881  hitchhiker  0.00992931 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1953  hypothetical protein  42.86 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000297307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1281  hypothetical protein  42.86 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000955438  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1769  hypothetical protein  42.86 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117921  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0126  hypothetical protein  42.86 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000293987  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1715  putative signal peptide protein  43.52 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1039  hypothetical protein  42.86 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0000138687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0901  hypothetical protein  43.78 
 
 		 216 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1506  hypothetical protein  38.56 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212232  hitchhiker  0.0000144009 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1530  hypothetical protein  38.56 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1798  hypothetical protein  42.86 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0851898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1777  hypothetical protein  42.86 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1050  hypothetical protein  38.56 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0955  putative exported lipoprotein  40.48 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833398  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4138  hypothetical protein  46.79 
 
 		 281 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.955129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1723  hypothetical protein  43.41 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0130536  hitchhiker  0.0000757016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3032  putative exported lipoprotein  42.95 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338968  decreased coverage  0.00314115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2329  hypothetical protein  44.64 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.09763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0718  putative exported lipoprotein  37.26 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.261936  normal  0.297451 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1966  signal peptide protein  44.64 
 
 		 210 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.874063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2366  putative signal peptide protein  44.05 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.369629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2164  signal peptide protein  37.67 
 
 		 210 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0709272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6346  hypothetical protein  31.94 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2317  putative lipoprotein  33.91 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.927495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2694  hypothetical protein  33.91 
 
 		 212 aa  85.5  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4717  hypothetical protein  31 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0538703  normal  0.011152 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2208  hypothetical protein  32.9 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>