More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4311 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  87.56 
 
 		 424 aa  678    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 432 aa  830    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 432 aa  830    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  68.59 
 
 		 415 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  66.83 
 
 		 419 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  62.31 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  53.27 
 
 		 422 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  56.68 
 
 		 406 aa  418  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  56.76 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  51.51 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  57.11 
 
 		 403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  54.66 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  53.68 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  56.01 
 
 		 479 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  55.58 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  54.13 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  54.66 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  57.51 
 
 		 412 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  62.15 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  54.41 
 
 		 409 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  55.22 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  51.48 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  51.93 
 
 		 416 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  56.28 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  52.11 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  52.93 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  52.54 
 
 		 416 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  52.06 
 
 		 416 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  51.45 
 
 		 416 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  52.06 
 
 		 416 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  57.22 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  57.22 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  56.96 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  51.08 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  52.66 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  54.98 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  54.59 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  55.84 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  51.12 
 
 		 420 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 		 416 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  53.68 
 
 		 411 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  56.68 
 
 		 415 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  49.62 
 
 		 411 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  54.24 
 
 		 421 aa  359  6e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  52.9 
 
 		 416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  55.22 
 
 		 397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  49.37 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  52.04 
 
 		 408 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  48.52 
 
 		 415 aa  352  8e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  56.43 
 
 		 424 aa  350  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 413 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 413 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  44.66 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  49.39 
 
 		 429 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  44.89 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  48.02 
 
 		 410 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  48.99 
 
 		 457 aa  319  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  47.95 
 
 		 412 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  44.81 
 
 		 454 aa  309  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 414 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  44.44 
 
 		 399 aa  296  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  47.46 
 
 		 455 aa  293  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 403 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  47.99 
 
 		 412 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  42.44 
 
 		 437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  42.46 
 
 		 421 aa  275  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 411 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 499 aa  270  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 		 427 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  36.83 
 
 		 424 aa  267  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 427 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 427 aa  262  8e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  41.45 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 401 aa  253  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  40.36 
 
 		 407 aa  247  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 415 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  39.75 
 
 		 414 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 		 416 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  40.39 
 
 		 410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 418 aa  233  5e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 		 418 aa  232  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 401 aa  232  9e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 415 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  37.72 
 
 		 524 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  37.85 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 407 aa  152  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  34.67 
 
 		 431 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 432 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 418 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  30.73 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  30.63 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 447 aa  133  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>