28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4246 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  799    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  90.79 
 
 		 393 aa  734    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  799    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  55.15 
 
 		 390 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  52.27 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  52 
 
 		 391 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  50.13 
 
 		 384 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  40.26 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  40.92 
 
 		 377 aa  248  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  42.09 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  38.83 
 
 		 386 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2228  hypothetical protein  35.2 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207313  normal  0.171513 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  34.55 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  34.14 
 
 		 388 aa  166  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  33.07 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  32.45 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000297045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  31.48 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  32.45 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  30.53 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5504  hypothetical protein  27.07 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4921  hypothetical protein  27.86 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.640656  normal  0.943138 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  28.65 
 
 		 377 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  24.51 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  24.69 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  29.35 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  29.35 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4149  hypothetical protein  29.38 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359659  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_002950  PG2078  hypothetical protein  22.04 
 
 		 390 aa  53.5  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>