More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4197 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 331 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 331 aa  675    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  61.51 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  61.32 
 
 		 317 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 342 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  60.69 
 
 		 317 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  57.63 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 333 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  61.3 
 
 		 331 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  56.84 
 
 		 341 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  56.84 
 
 		 341 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  61.9 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  58.26 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  57.32 
 
 		 338 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  61.76 
 
 		 325 aa  346  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  58.71 
 
 		 330 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  58.73 
 
 		 333 aa  338  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 333 aa  315  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  50.64 
 
 		 325 aa  312  4.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  47.94 
 
 		 335 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  47.94 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  47.3 
 
 		 335 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  47.77 
 
 		 318 aa  295  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  52.06 
 
 		 342 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  44.59 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  47.04 
 
 		 318 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  46.56 
 
 		 321 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  46.73 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  46.73 
 
 		 318 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  46.73 
 
 		 318 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  46.73 
 
 		 318 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  46.73 
 
 		 318 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  46.25 
 
 		 321 aa  278  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  47.15 
 
 		 321 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 317 aa  270  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 346 aa  269  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  46.84 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  46.52 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  46.2 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  45.94 
 
 		 320 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  45.94 
 
 		 320 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 321 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  45.31 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  45.08 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  45.51 
 
 		 350 aa  262  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  45.62 
 
 		 320 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  45 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  42.41 
 
 		 316 aa  258  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  43.3 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  43.3 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  43.3 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  47.32 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1531  transcriptional regulator, AraC family  49.37 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  43.93 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  41.39 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5972  transcriptional regulator, AraC family  46.2 
 
 		 343 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  46.65 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  45.71 
 
 		 317 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  45.8 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  44.51 
 
 		 322 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  46.37 
 
 		 334 aa  248  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  41.49 
 
 		 331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  44.97 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  41.19 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  42.63 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4139  ThiJ/PfpI domain protein  42.63 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  41.18 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  42.06 
 
 		 326 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2725  transcriptional regulator, AraC family  45.25 
 
 		 320 aa  242  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  41.49 
 
 		 329 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  42.72 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  41.07 
 
 		 333 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  40.19 
 
 		 317 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  40.48 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  40.95 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 342 aa  235  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  39.69 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  42.27 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  42.14 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 331 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  42.9 
 
 		 356 aa  232  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 		 322 aa  232  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 349 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  45.73 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  44.65 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  43.03 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 314 aa  225  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  43.44 
 
 		 362 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  43.34 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  40.5 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>