More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4125 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 240 aa  481  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 240 aa  481  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  92.5 
 
 		 240 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  73 
 
 		 277 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  73 
 
 		 241 aa  351  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  73 
 
 		 241 aa  351  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  73 
 
 		 241 aa  351  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  73 
 
 		 241 aa  351  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  73 
 
 		 241 aa  351  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  73 
 
 		 241 aa  351  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  72.57 
 
 		 277 aa  348  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  70 
 
 		 240 aa  348  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  62.5 
 
 		 247 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  62.92 
 
 		 243 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 308 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 243 aa  297  9e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 243 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  55.04 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 245 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  59.07 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  53.16 
 
 		 247 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 245 aa  252  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 245 aa  194  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0732  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.128467  decreased coverage  0.000000465533 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1823  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  42.67 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  38.36 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 		 258 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  37.16 
 
 		 269 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  37.73 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 376 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 376 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 284 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  37.89 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 271 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 274 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.64 
 
 		 286 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 287 aa  134  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.05 
 
 		 256 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  37.72 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 		 249 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 274 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 262 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.89 
 
 		 280 aa  119  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 258 aa  118  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 270 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  36.36 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3817  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 256 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0594434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 245 aa  105  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  36.65 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>