285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4071 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3958  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3273  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  59.38 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3438  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.82 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5175  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.81 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4351  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.38 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3955  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.69 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0529615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2656  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.21 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3076  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.12 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0023  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00721211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.69 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.69 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.27 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.23 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.6 
 
 		 204 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.19 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3105  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.89 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.68 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.89 
 
 		 202 aa  122  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.11 
 
 		 199 aa  121  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.6 
 
 		 204 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.86 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4073  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.56 
 
 		 193 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0245  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  33.84 
 
 		 199 aa  114  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.76 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1117  acyl carrier protein phosphodiesterase  40 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.22 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  39.13 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.57 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.57 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.22 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.18 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.18 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3545  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.34 
 
 		 207 aa  111  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114749  normal  0.056833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.98 
 
 		 198 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.34 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.68 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.68 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.84 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.68 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.87 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.67 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.67 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.67 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.67 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.67 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.67 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.68 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.67 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  38.41 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  35 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  39.25 
 
 		 202 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.65 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.33 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  34.92 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.24 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.26 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2008  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.99 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  35.26 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  35.18 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 		 199 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  34.17 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  34.21 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  34.74 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  34.67 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  34.21 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  34.21 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0354  FMN-dependent NADH-azoreductase 1  51.4 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  34.74 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  34.74 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  34.74 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  34.74 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.98 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  35.47 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.24 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.47 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  35.94 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  34.21 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  33.84 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54120  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.32 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.02 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.44 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.87 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  37.36 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  34.78 
 
 		 202 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.47 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.89 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  37.1 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  37.36 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  36.59 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1679  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.32 
 
 		 192 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.32 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.17 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  33.33 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2463  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.46 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>