More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4046 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4053  maltooligosyl trehalose synthase  49.09 
 
 
924 aa  770    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114095  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1790  maltooligosyl trehalose synthase  48.56 
 
 
924 aa  763    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571899  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6326  malto-oligosyltrehalose synthase  48.25 
 
 
924 aa  721    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0514594  normal  0.0507365 
 
 
-
 
NC_003296  RS05188  putative maltooligosyl trehalose synthase transmembrane protein  73.51 
 
 
940 aa  1281    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3128  glycosyl hydrolase, family 13  46.91 
 
 
927 aa  750    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0615  malto-oligosyltrehalose synthase  47.55 
 
 
930 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0816  maltooligosyl trehalose synthase, putative  47.55 
 
 
930 aa  701    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.133141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2995  maltooligosyl trehalose synthase  46.84 
 
 
927 aa  752    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506264  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4234  alpha amylase domain-containing protein  44.89 
 
 
884 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116364  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.95 
 
 
1715 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0946  alpha amylase  42.62 
 
 
948 aa  648    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206835  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.44 
 
 
1646 aa  649    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1733  malto-oligosyltrehalose synthase  47.55 
 
 
967 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2546  maltooligosyl trehalose synthase  47.28 
 
 
925 aa  746    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7028  maltooligosyl trehalose synthase  46.96 
 
 
923 aa  696    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187701  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.21 
 
 
1642 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.44 
 
 
1650 aa  655    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0546  malto-oligosyltrehalose synthase  45.77 
 
 
836 aa  666    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1416  malto-oligosyltrehalose synthase  43.66 
 
 
941 aa  733    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0169587  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2867  putative glycosyl hydrolase  49.33 
 
 
952 aa  830    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1336  malto-oligosyltrehalose synthase  48.1 
 
 
921 aa  724    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253875  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  43.11 
 
 
1646 aa  648    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5596  malto-oligosyltrehalose synthase  48.19 
 
 
924 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49211  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36605  maltooligosyl trehalose synthase  47.92 
 
 
926 aa  737    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6493  malto-oligosyltrehalose synthase  48.05 
 
 
921 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576977  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5485  malto-oligosyltrehalose synthase  48.27 
 
 
920 aa  690    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102779 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4046  malto-oligosyltrehalose synthase  100 
 
 
940 aa  1888    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240234  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24880  maltooligosyl trehalose synthase  48.62 
 
 
917 aa  753    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.022043  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2280  maltooligosyl trehalose synthase  48.87 
 
 
914 aa  757    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0184477  hitchhiker  0.00895039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6827  malto-oligosyltrehalose synthase  49.02 
 
 
951 aa  819    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.554388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1821  maltooligosyl trehalose synthase  48.4 
 
 
924 aa  759    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280947 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3933  malto-oligosyltrehalose synthase  100 
 
 
940 aa  1888    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.734301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3144  maltooligosyl trehalose synthase  48.24 
 
 
926 aa  736    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1460  malto-oligosyltrehalose synthase  46.76 
 
 
918 aa  687    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251406  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3652  maltooligosyl trehalose synthase  48.35 
 
 
924 aa  761    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116704  normal  0.178483 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4387  malto-oligosyltrehalose synthase  48.85 
 
 
944 aa  808    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.454726 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1334  malto-oligosyltrehalose synthase  47.55 
 
 
930 aa  701    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.929488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0540  malto-oligosyltrehalose synthase  47.55 
 
 
930 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6082  malto-oligosyltrehalose synthase  48.26 
 
 
922 aa  726    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292692 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1539  alpha-amylase family protein  47.77 
 
 
930 aa  704    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.604212  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1562  malto-oligosyltrehalose synthase  47.44 
 
 
930 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.497391  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  43.8 
 
 
1703 aa  634  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2094  maltooligosyl trehalose synthase  39.2 
 
 
986 aa  631  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  42.22 
 
 
1647 aa  628  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.36 
 
 
1730 aa  609  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.19 
 
 
1633 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6326  putative glycosyl hydrolase (glycosidase)  39.4 
 
 
934 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.420864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2081  alpha-amylase family protein  41.22 
 
 
969 aa  601  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.62 
 
 
1673 aa  599  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1738  malto-oligosyltrehalose synthase  41.22 
 
 
969 aa  601  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.137829  hitchhiker  0.0000132957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2351  malto-oligosyltrehalose synthase  37.42 
 
 
955 aa  599  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4168  malto-oligosyltrehalose synthase  39.1 
 
 
928 aa  595  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1879  malto-oligosyltrehalose synthase  40.84 
 
 
928 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0319  malto-oligosyltrehalose synthase  40.32 
 
 
913 aa  592  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3267  maltooligosyl trehalose synthase  37.13 
 
 
995 aa  592  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.09 
 
 
1662 aa  589  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1427  Alpha amylase, catalytic region  36.74 
 
 
922 aa  588  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.627603  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0507  Alpha amylase, catalytic region  41.88 
 
 
939 aa  587  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.213544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3682  malto-oligosyltrehalose synthase  41.06 
 
 
926 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2673  malto-oligosyltrehalose synthase  38.43 
 
 
856 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.299431  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1680  (1,4)-alpha-D-glucan 1-alpha-D-glucosylmutase  37.6 
 
 
940 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.810186  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3487  malto-oligosyltrehalose synthase  40.07 
 
 
929 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1811  malto-oligosyltrehalose synthase  37.65 
 
 
955 aa  580  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3468  maltooligosyl trehalose synthase  36.44 
 
 
994 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1461  malto-oligosyltrehalose synthase  39.77 
 
 
950 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0539  malto-oligosyltrehalose synthase  39.4 
 
 
944 aa  573  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1429  malto-oligosyltrehalose synthase  34.69 
 
 
942 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0930429  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2360  maltooligosyl trehalose synthase  36.34 
 
 
996 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1395  malto-oligosyltrehalose synthase  34.58 
 
 
942 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03372  malto-oligosyltrehalose synthase  40.99 
 
 
869 aa  565  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4620  malto-oligosyltrehalose synthase  34.97 
 
 
930 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.026371 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7155  malto-oligosyltrehalose synthase  38.94 
 
 
869 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6007  malto-oligosyltrehalose synthase  39.16 
 
 
869 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.074206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0115  maltooligosyl trehalose synthase  34.16 
 
 
994 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.136948 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0317  maltooligosyl trehalose synthase  38.27 
 
 
1013 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0021368  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5462  malto-oligosyltrehalose synthase  36.71 
 
 
843 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0134  maltooligosyl trehalose synthase  34.06 
 
 
994 aa  544  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2452  maltooligosyl trehalose synthase  38.32 
 
 
871 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2763  malto-oligosyltrehalose synthase  35.85 
 
 
1007 aa  534  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200258  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  35.43 
 
 
1411 aa  532  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0304  maltooligosyl trehalose synthase  39.57 
 
 
1007 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  34.33 
 
 
1405 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1115  maltooligosyl trehalose synthase  38.61 
 
 
871 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3112  malto-oligosyltrehalose synthase  34.93 
 
 
935 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4561  malto-oligosyltrehalose synthase  39.31 
 
 
879 aa  525  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0315  maltooligosyl trehalose synthase  39.61 
 
 
1007 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0293  maltooligosyl trehalose synthase  38.74 
 
 
1009 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1784  malto-oligosyltrehalose synthase  36.38 
 
 
842 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1673  malto-oligosyltrehalose synthase  36.49 
 
 
842 aa  515  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1736  malto-oligosyltrehalose synthase  36.06 
 
 
842 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566419  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1606  malto-oligosyltrehalose synthase  36.06 
 
 
842 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.630708  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1779  maltooligosyl trehalose synthase  37.87 
 
 
873 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1671  malto-oligosyltrehalose synthase  36.06 
 
 
842 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2012  malto-oligosyltrehalose synthase  36.83 
 
 
945 aa  498  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3378  malto-oligosyltrehalose synthase  39.01 
 
 
848 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2573  malto-oligosyltrehalose synthase  34.52 
 
 
875 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2602  a-glycosidase, maltooligosyl trehalose synthase, glycoside hydrolase family 13 protein  32.01 
 
 
916 aa  473  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5165  malto-oligosyltrehalose synthase  36.81 
 
 
864 aa  472  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4211  maltooligosyl trehalose synthase  35.67 
 
 
875 aa  466  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0039  malto-oligosyltrehalose synthase  34.51 
 
 
909 aa  435  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>