62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3940 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 160 aa  332  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3940  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 160 aa  332  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5344  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  91.88 
 
 		 160 aa  309  9e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1822  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  91.25 
 
 		 160 aa  305  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0709153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3578  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  90.74 
 
 		 162 aa  304  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1137  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  84.38 
 
 		 166 aa  287  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0488  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.75 
 
 		 156 aa  245  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5764  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.43 
 
 		 158 aa  240  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2515  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70 
 
 		 161 aa  238  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.90786  normal  0.0126588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1345  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.05 
 
 		 161 aa  237  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317046  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2346  hypothetical protein  75.89 
 
 		 154 aa  237  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.84 
 
 		 173 aa  233  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2829  glyoxalase family protein  71.88 
 
 		 160 aa  226  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0653  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.73 
 
 		 147 aa  207  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6166  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.9 
 
 		 159 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.67 
 
 		 159 aa  193  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0332  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.498296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0960  glyoxalase family protein family  55.9 
 
 		 168 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2265  hypothetical protein  54.37 
 
 		 151 aa  176  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.715595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0455  glyoxalase family protein family  61.79 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0956574  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1881  glyoxalase family protein  53.37 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.966577  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0912  hypothetical protein  53.37 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0559  hypothetical protein  53.37 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0323612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2036  glyoxalase family protein  60.98 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1941  glyoxalase family protein  60.98 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3467  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.12 
 
 		 157 aa  160  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2338  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.74 
 
 		 161 aa  152  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.423642  normal  0.441606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1442  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.43 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.14 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326037  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2965  lactoylglutathione lyase, glyoxalase family protein  39.51 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3223  glyoxalase family protein  39.51 
 
 		 145 aa  124  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2900  lactoylglutathione lyase, glyoxalase family protein  40.12 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3203  glyoxalase family protein  38.89 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2060  glyoxalase family protein  39.51 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3209  glyoxalase family protein  39.51 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3198  glyoxalase family protein  38.89 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2973  glyoxalase family protein  38.89 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000833367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3188  glyoxalase family protein  38.89 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2921  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.97 
 
 		 145 aa  120  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0045166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0535  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.61 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1653  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.72 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00264078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4156  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.33 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2234  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.81 
 
 		 141 aa  98.6  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.400995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1434  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.29 
 
 		 161 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12659  cadmium inducible protein cadI  35.92 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4826  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.56 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37864  normal  0.915337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.79 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.0139362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.1 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2998  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.41 
 
 		 153 aa  87  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.41 
 
 		 153 aa  87  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.91747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0564  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.21 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3470  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.17 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1557  hypothetical protein  28.37 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0324701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.86 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4906  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.48 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2680  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.33 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00951722  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26430  lactoylglutathione lyase-like lyase  29.5 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.258719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0789  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02000  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  33.05 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0163  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  25.83 
 
 		 287 aa  41.2  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>