129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3751 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  100 
 
 		 286 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  100 
 
 		 286 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  79.86 
 
 		 287 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  79.86 
 
 		 287 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6184  methyltransferase  77.62 
 
 		 289 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  79.86 
 
 		 287 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  76.92 
 
 		 285 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0022  hypothetical protein  75.52 
 
 		 286 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  78.06 
 
 		 293 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  78.06 
 
 		 292 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4009  methyltransferase  74.48 
 
 		 286 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0764257  normal  0.338849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  65.03 
 
 		 285 aa  362  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1091  MerR family transcriptional regulator  64.24 
 
 		 286 aa  354  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0738969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1806  hypothetical protein  64.58 
 
 		 286 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0944  hypothetical protein  64.24 
 
 		 286 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0354  MerR family transcriptional regulator  64.24 
 
 		 286 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0437  hypothetical protein  64.24 
 
 		 286 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0209  hypothetical protein  64.24 
 
 		 286 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1892  hypothetical protein  64.24 
 
 		 286 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1396  hypothetical protein  64.24 
 
 		 286 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3713  methyltransferase  61.19 
 
 		 285 aa  348  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1213  protein of unknown function Mtu_121  63.86 
 
 		 285 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2748  methyltransferase  63.86 
 
 		 285 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2654  methyltransferase  62.11 
 
 		 285 aa  325  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 648 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 630 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 604 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 630 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 604 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 604 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 659 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 604 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 639 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2212  putative methyltransferase  37.31 
 
 		 285 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  41.99 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4307  hypothetical protein  34.18 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2234  methyltransferase  41.67 
 
 		 276 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0473874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1717  methyltransferase  37.87 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.203121  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0827  putative methyltransferase  29.24 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  40.28 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1707  hypothetical protein  32.7 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.410667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2941  hypothetical protein  28.12 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.324225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3264  hypothetical protein  28.77 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0188  putative methyltransferase  34.74 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3250  hypothetical protein  32.38 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3019  hypothetical protein  32.38 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3004  hypothetical protein  33.81 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3252  hypothetical protein  32.38 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000435878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2007  hypothetical protein  31.6 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000735866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3270  methyltransferase, putative, family  27.74 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.716508  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  33.09 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  29.41 
 
 		 295 aa  92.4  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  36.88 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  32.35 
 
 		 306 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1131  methyltransferase  30.7 
 
 		 304 aa  89.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020137  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13821  hypothetical protein  39.39 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  39.47 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1045  hypothetical protein  40.65 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1061  putative methyltransferase  40.65 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1073  putative methyltransferase  40.65 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  28.32 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  31.37 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  34.65 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11746  hypothetical protein  32.92 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.399672 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  28.16 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  37.32 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5023  putative methyltransferase  37.33 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.388  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  37.17 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1344  putative methyltransferase  34.84 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  35.09 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1226  methyltransferase  30.7 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0104  putative methyltransferase  43.59 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1071  putative methyltransferase  34.84 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13799  hypothetical protein  35.15 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.224674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  23.99 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0743  putative methyltransferase  38.64 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12764  hypothetical protein  31.84 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.454721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1043  hypothetical protein  34.19 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1059  putative methyltransferase  34.19 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.769331  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10745  hypothetical protein  36.55 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.397623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  38.57 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1345  putative methyltransferase  35.9 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2390  putative methyltransferase  36.62 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206641  normal  0.0346266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3240  hypothetical protein  28.36 
 
 		 150 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10845  hypothetical protein  32.54 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203136  hitchhiker  0.000000140012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3841  methyltransferase  36.84 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1545  putative methyltransferase  33.77 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  34.23 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1346  putative methyltransferase  37.76 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1072  putative methyltransferase  36.23 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  36.03 
 
 		 798 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0089  hypothetical protein  36.96 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1018  methyltransferase  30.8 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.514126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0098  putative methyltransferase  36.96 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.154609 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2218  hypothetical protein  41.6 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0088  hypothetical protein  41.03 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0369  hypothetical protein  36.43 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1044  hypothetical protein  35.51 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1060  putative methyltransferase  35.51 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>