152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3652 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  100 
 
 		 245 aa  480  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  100 
 
 		 245 aa  480  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  89.92 
 
 		 248 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  36.32 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  38.33 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  39.44 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  29.78 
 
 		 231 aa  115  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  39.63 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  29.17 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  37.22 
 
 		 278 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  37.72 
 
 		 207 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  38.32 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  38.32 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  38.32 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  38.32 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  38.32 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  38.32 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  28.7 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  28.7 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  28.7 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  32.05 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  37.13 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  38.36 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  32.48 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  37.11 
 
 		 227 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  37.11 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  38.36 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  33.18 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  32.09 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  33.77 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  36.59 
 
 		 227 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  33.92 
 
 		 236 aa  95.5  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  31.55 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  34.12 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  35.71 
 
 		 201 aa  92  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  29.09 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  30.77 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  33.72 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  31.87 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  29.02 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  30.04 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  30.49 
 
 		 268 aa  88.6  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  29.52 
 
 		 241 aa  86.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2452  flagellar assembly protein H  37.74 
 
 		 227 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0964661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3066  flagellar assembly protein H  37.74 
 
 		 227 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00102567  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  29.11 
 
 		 244 aa  85.9  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  29.82 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  29.18 
 
 		 244 aa  85.9  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  32.21 
 
 		 307 aa  85.1  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  30.29 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  35 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  30.29 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  30.29 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  30.29 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  30.47 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  31.85 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  33.75 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  33.75 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  33.75 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  33.75 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  29.61 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  28.64 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  28.65 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  27.44 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  30.92 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  26.74 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  31.63 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  27.59 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  25.56 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  24.18 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  27.66 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  24.18 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  24.18 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  24.18 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1722  polar flagellar assembly protein FliH  22.5 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  26.04 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  25.77 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  25.73 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  25.85 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  27.14 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1722  polar flagellar assembly protein FliH  22.5 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  25.68 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  28.96 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  22.32 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  27.61 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  25 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  26.04 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  25.26 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  23.43 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  27.16 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  30.56 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  25.81 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  25.14 
 
 		 375 aa  62  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  28.04 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  25.85 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  26.35 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  27.89 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  23.41 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25.7 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  26.12 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>