165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3591 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  68.91 
 
 		 204 aa  272  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  69.43 
 
 		 204 aa  270  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  66.32 
 
 		 204 aa  264  8e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  66.32 
 
 		 204 aa  261  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  59.07 
 
 		 212 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  54.55 
 
 		 217 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  55.61 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  55.1 
 
 		 217 aa  222  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  55.38 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  55.44 
 
 		 208 aa  221  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  55.44 
 
 		 208 aa  221  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  57.14 
 
 		 209 aa  221  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  56.63 
 
 		 211 aa  218  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  54.92 
 
 		 215 aa  208  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  48.34 
 
 		 233 aa  207  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  52.58 
 
 		 215 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  51.27 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  52.53 
 
 		 202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  50.25 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  52.02 
 
 		 202 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  49.25 
 
 		 202 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  50.76 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  47.92 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  51.27 
 
 		 209 aa  191  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  51.03 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  48.44 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  50.52 
 
 		 237 aa  184  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  52.08 
 
 		 237 aa  184  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  47.92 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  49.74 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  45.69 
 
 		 214 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  43.32 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  48.21 
 
 		 211 aa  174  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  47.42 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  47.69 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  47.18 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  43.88 
 
 		 202 aa  165  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  46.19 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  46.19 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  45.69 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  42.64 
 
 		 200 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  44.29 
 
 		 237 aa  154  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  42.71 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  43.81 
 
 		 198 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  45.64 
 
 		 202 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  41.21 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  40.21 
 
 		 208 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  47.64 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  36.36 
 
 		 217 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  36.46 
 
 		 212 aa  124  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  34.03 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  36.73 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  41.03 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  32.98 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  59.57 
 
 		 109 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  40.53 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  36.28 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  30.26 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  33.13 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  32.32 
 
 		 287 aa  78.2  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  33.11 
 
 		 281 aa  78.2  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  31.9 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  26.95 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  29.09 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  30 
 
 		 311 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  29.11 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  33.82 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  29.41 
 
 		 313 aa  65.1  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  27.38 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  27.41 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  28.86 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  29.66 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  29.66 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16380  hypothetical protein  27.46 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000759545  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  23.92 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  26.83 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0536  hypothetical protein  30.12 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  28.3 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  23.87 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  25.17 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  25.64 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  30.64 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  21.6 
 
 		 299 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0930  hypothetical protein  30.11 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0214742  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1201  protein of unknown function DUF161  27.69 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895465 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2046  protein of unknown function DUF161  25.51 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.302347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  26.38 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  27.75 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  29.19 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  27.72 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1456  hypothetical protein  21.92 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0996755  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  22.98 
 
 		 322 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1254  hypothetical protein  22.07 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  27.81 
 
 		 323 aa  52.8  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  24.72 
 
 		 298 aa  52.8  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2353  protein of unknown function DUF161  23.39 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0771  hypothetical protein  25 
 
 		 283 aa  52.4  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103591  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  27.06 
 
 		 292 aa  51.6  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>