250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3487 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  100 
 
 		 395 aa  780    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  100 
 
 		 395 aa  780    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  79.73 
 
 		 375 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  56.78 
 
 		 368 aa  332  8e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  37.98 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  29.92 
 
 		 377 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  32.11 
 
 		 367 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  33.79 
 
 		 333 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  29.41 
 
 		 383 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  33.24 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  31.89 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  28.21 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  31.92 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  35.2 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  27.22 
 
 		 353 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  34.52 
 
 		 344 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  29.22 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  29.22 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  27.99 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  31.22 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  34.22 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  30.49 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  30.07 
 
 		 354 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  30.38 
 
 		 374 aa  99.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  32.17 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  34.38 
 
 		 338 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  29.38 
 
 		 367 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  33.7 
 
 		 351 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  31.59 
 
 		 344 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  29.49 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  32.09 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  33.76 
 
 		 340 aa  94  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  30.89 
 
 		 354 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  29.51 
 
 		 364 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  33.76 
 
 		 344 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  29.59 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  30.92 
 
 		 384 aa  90.1  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  30.48 
 
 		 355 aa  89.4  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  28.38 
 
 		 362 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  30.56 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  30.87 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  28.23 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  29.3 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  28.49 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  27.13 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  28.73 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  26.06 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  31.17 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  29.59 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  28.19 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  32.32 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  34.32 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  29.87 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  32.77 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  30.93 
 
 		 681 aa  76.6  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  27.68 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  25.98 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  27.71 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  28.07 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  30.26 
 
 		 682 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  21.56 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  31.1 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  25.4 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  28.66 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  27.57 
 
 		 656 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  33.06 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  27.79 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  28.38 
 
 		 675 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6254  acyltransferase 3  29.46 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4121  acyltransferase 3  26.82 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184314  normal  0.5023 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  27.5 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  25.2 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  28.82 
 
 		 587 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  27.93 
 
 		 662 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  29.09 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  27.52 
 
 		 645 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  24.38 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  27.09 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  27.83 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  26.48 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  27.91 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  27.33 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  27.08 
 
 		 675 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3493  acyltransferase 3  21.08 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0867456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  21.86 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  24.35 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  28.35 
 
 		 742 aa  57.4  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  27.23 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  26.69 
 
 		 660 aa  57  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  26.41 
 
 		 422 aa  57  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  29.08 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  27.23 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  27.23 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  24.79 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  28.12 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  27.74 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  27.71 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  23.95 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  25.52 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  25.38 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>