93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3371 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 320 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  96.99 
 
 		 321 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  76.98 
 
 		 325 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  51.7 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  47.5 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  39.32 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  36.51 
 
 		 283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  35.32 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  36.51 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  36.75 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  37.86 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  35.04 
 
 		 272 aa  93.2  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  33.2 
 
 		 283 aa  89.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  28.22 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  31.77 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  34.69 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  27.92 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  31.48 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  28.79 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  30.14 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  28.03 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  26.61 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  26.29 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  30.74 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0738  dienelactone hydrolase  29.96 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  35.71 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  28.08 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  30 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0091  dienelactone hydrolase  29.17 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  32.24 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  32.28 
 
 		 423 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  26.42 
 
 		 261 aa  53.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  29.9 
 
 		 423 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0171  dienelactone hydrolase  28.02 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  29.9 
 
 		 423 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  25.96 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  25.89 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  30.69 
 
 		 423 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  26.44 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  30.69 
 
 		 418 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  26.8 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  30.69 
 
 		 419 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1095  hypothetical protein  35.19 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.103267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  23.94 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  30.64 
 
 		 302 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  30.69 
 
 		 423 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  25.74 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  30.21 
 
 		 741 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2606  hypothetical protein  36.13 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  26.24 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  24.22 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  24.22 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  24.22 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  24.22 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  29.73 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.31 
 
 		 302 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.4 
 
 		 628 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1077  esterase YpfH  27.21 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.213936  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  32 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.84 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  30.41 
 
 		 423 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.39 
 
 		 688 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  27.12 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  38.57 
 
 		 425 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  23.71 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3082  hypothetical protein  30.41 
 
 		 442 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  24.14 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  28.21 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2013  peptidase  30.41 
 
 		 441 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0393  hypothetical protein  30.41 
 
 		 442 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0414  hypothetical protein  30.41 
 
 		 442 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2274  hypothetical protein  30.41 
 
 		 442 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  32 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  24.14 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0575  hypothetical protein  30.41 
 
 		 432 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  30.33 
 
 		 646 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  24.14 
 
 		 267 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  24.14 
 
 		 269 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.94 
 
 		 596 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.1 
 
 		 692 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  24.14 
 
 		 269 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.32 
 
 		 691 aa  43.5  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  26.09 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  24.14 
 
 		 271 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  29.81 
 
 		 450 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3037  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain-containing protein  31.48 
 
 		 685 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  24.14 
 
 		 270 aa  43.1  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  24.23 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  25.82 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  36.36 
 
 		 429 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241726 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06093  Acetylxylan esterase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS5]  26.15 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00247339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2979  esterase YpfH  27.94 
 
 		 228 aa  42.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5657  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.14 
 
 		 693 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.56481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>