More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3328 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 303 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  97.69 
 
 		 303 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  88.93 
 
 		 301 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0169  phosphomethylpyrimidine kinase  69.2 
 
 		 276 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0212  phosphomethylpyrimidine kinase  68.38 
 
 		 290 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  54.8 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  54.8 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  55 
 
 		 288 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  53.9 
 
 		 280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  54.95 
 
 		 285 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  57.09 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  56.72 
 
 		 283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0889  phosphomethylpyrimidine kinase  50.17 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000698623  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  57.41 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  54.1 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  48.89 
 
 		 267 aa  232  6e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  48.7 
 
 		 262 aa  231  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  47.23 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  47.06 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  51.31 
 
 		 266 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 		 268 aa  228  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  51.31 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  51.31 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  53.87 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  49.63 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  51.5 
 
 		 268 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  45.93 
 
 		 268 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  49.63 
 
 		 273 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  56.77 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  51.88 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  48.35 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  43.87 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  46.62 
 
 		 266 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 270 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 260 aa  215  7e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  50.37 
 
 		 268 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  52.4 
 
 		 263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  51.79 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 		 266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 		 266 aa  212  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 		 266 aa  212  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 		 266 aa  212  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 		 266 aa  212  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 		 266 aa  212  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 		 266 aa  212  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 266 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  48.69 
 
 		 267 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  47.53 
 
 		 266 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  48.36 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  47.35 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  52.06 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  48.18 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 		 266 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  51.69 
 
 		 268 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 		 266 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  52.01 
 
 		 275 aa  209  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  53.48 
 
 		 293 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  45.25 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  46.04 
 
 		 277 aa  209  5e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  46.62 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 		 264 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  46.84 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  46.04 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  47.17 
 
 		 267 aa  205  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  45.45 
 
 		 269 aa  205  7e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  56.18 
 
 		 267 aa  205  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 270 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  47.39 
 
 		 264 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  42.07 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  45.66 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  46.97 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 		 269 aa  201  9e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  47.01 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  47.62 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  48.23 
 
 		 271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  50.18 
 
 		 272 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  41.33 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  51.2 
 
 		 266 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  49.82 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  40.37 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1765  phosphomethylpyrimidine kinase  55.13 
 
 		 260 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.962126  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  40.74 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  42.96 
 
 		 286 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  43.91 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  44.61 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  48.87 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  44.48 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>