More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3011 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3079  composite two component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  59.19 
 
 		 994 aa  970    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0449118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1436 aa  2896    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0358  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 		 1485 aa  755    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0633  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 		 1480 aa  800    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461456  normal  0.141694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4067  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 1490 aa  792    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4255  PAS/PAC sensor, hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 1418 aa  778    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4605  histidine protein kinase  37.22 
 
 		 1309 aa  729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.292459  normal  0.0589738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  96.03 
 
 		 1436 aa  2726    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 1194 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0814409  normal  0.0127622 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 		 1237 aa  602  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473456  normal  0.0283242 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.67 
 
 		 948 aa  416  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 		 1681 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 1681 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  26.93 
 
 		 1689 aa  328  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  30.98 
 
 		 1135 aa  328  5e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4445  response regulator/sensor histidine kinase  35.79 
 
 		 1141 aa  325  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 1141 aa  321  6e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  27.47 
 
 		 1686 aa  314  9e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 1255 aa  313  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5724  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31.81 
 
 		 784 aa  310  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2675  sensor histidine kinase/response regulator  38.3 
 
 		 651 aa  308  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 		 940 aa  306  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 		 1303 aa  303  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 		 816 aa  302  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 1692 aa  295  4e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 		 1245 aa  294  7e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 1033 aa  294  9e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  35.78 
 
 		 1322 aa  291  7e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1617  Signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 644 aa  291  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  35.56 
 
 		 955 aa  291  8e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0684  sensor histidine kinase/response regulator  36.22 
 
 		 654 aa  290  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1402  sensor histidine kinase/response regulator  36.22 
 
 		 654 aa  290  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0878  sensor histidine kinase/response regulator  36.22 
 
 		 654 aa  290  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0474  sensor histidine kinase/response regulator  36.22 
 
 		 639 aa  290  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  34.48 
 
 		 1064 aa  288  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1639  response regulator/sensor histidine kinase  36.06 
 
 		 693 aa  288  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  37.1 
 
 		 977 aa  288  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.23 
 
 		 923 aa  287  9e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1795  sensor histidine kinase/response regulator  36.06 
 
 		 654 aa  287  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5043  PAS  35.88 
 
 		 855 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.563138  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.33 
 
 		 2213 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.39 
 
 		 1763 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.95 
 
 		 1233 aa  284  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 		 1267 aa  284  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 		 1234 aa  284  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  36.13 
 
 		 1014 aa  284  8.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 		 1236 aa  283  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  32.34 
 
 		 891 aa  282  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 		 1236 aa  282  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 		 1236 aa  281  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 		 1240 aa  281  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 		 1236 aa  278  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 		 1064 aa  278  8e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.74 
 
 		 852 aa  277  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3210  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.95 
 
 		 951 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 1054 aa  276  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  34.9 
 
 		 727 aa  276  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1266 aa  275  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  29.98 
 
 		 1188 aa  275  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 		 925 aa  275  6e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1106  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  35.04 
 
 		 951 aa  275  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 812 aa  275  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.64 
 
 		 934 aa  274  8.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 		 705 aa  274  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  28.94 
 
 		 1439 aa  273  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 		 1238 aa  274  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 		 1560 aa  274  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  37.23 
 
 		 785 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1767 aa  274  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33.4 
 
 		 1765 aa  273  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 678 aa  273  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00885051  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 1767 aa  273  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 		 1234 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1326 aa  272  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2615  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.45 
 
 		 915 aa  272  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.544475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 		 1230 aa  273  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 		 1582 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2511  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.26 
 
 		 948 aa  272  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0476144 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2456  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.26 
 
 		 948 aa  272  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290959  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 		 1238 aa  272  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  28.29 
 
 		 1200 aa  272  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  32.46 
 
 		 1055 aa  271  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  32.24 
 
 		 1177 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.26 
 
 		 948 aa  271  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 		 1238 aa  271  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  30.51 
 
 		 1331 aa  271  8.999999999999999e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  35.47 
 
 		 1353 aa  270  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.15 
 
 		 1053 aa  270  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 		 1238 aa  270  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.84 
 
 		 1499 aa  270  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.42 
 
 		 1442 aa  270  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 921 aa  271  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2497  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.07 
 
 		 948 aa  270  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147984  normal  0.803827 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 977 aa  270  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  38.46 
 
 		 785 aa  269  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 819 aa  269  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 1765 aa  268  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 		 1771 aa  268  8e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  34.32 
 
 		 850 aa  267  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.06 
 
 		 929 aa  267  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>