More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2956 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 419 aa  789    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  91.41 
 
 		 419 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  49.38 
 
 		 416 aa  305  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 393 aa  286  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  42.33 
 
 		 389 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  42.33 
 
 		 389 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  42.37 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  43.65 
 
 		 401 aa  243  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  44.81 
 
 		 422 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  44.59 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  43.41 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  41.41 
 
 		 404 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  42.67 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  42.74 
 
 		 447 aa  225  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  40.16 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  40.79 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  40.16 
 
 		 400 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 405 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  45.04 
 
 		 408 aa  216  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 388 aa  216  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  45.27 
 
 		 431 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  44.54 
 
 		 413 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  47.68 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000369004  unclonable  0.0000000000514998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  47.68 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  47.68 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000378785  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  39.84 
 
 		 406 aa  200  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  37.24 
 
 		 399 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 		 397 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 404 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0028  MFS permease  44.74 
 
 		 422 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000623855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3860  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 442 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3799  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 433 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000291886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  40.57 
 
 		 400 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  42.82 
 
 		 399 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  43.11 
 
 		 401 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  45.65 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  38.25 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  44.11 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0236  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 423 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00013187  hitchhiker  0.000000000803869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0228  major facilitator transporter  47.16 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000132249  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 415 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  30.17 
 
 		 392 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  30 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  30 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  30 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 426 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  38.5 
 
 		 403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  37.09 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 394 aa  164  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 		 394 aa  163  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 		 423 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  38.59 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 390 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  35.91 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  35.91 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  35.91 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  35.91 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>